Protein–RNA interactions for Protein: Q16595

FXN, Frataxin, mitochondrial, humanhuman

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Length 210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXNQ16595 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FXNQ16595 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FXNQ16595 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FXNQ16595 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FXNQ16595 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FXNQ16595 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FXNQ16595 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FXNQ16595 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
FXNQ16595 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
FXNQ16595 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
FXNQ16595 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
FXNQ16595 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
FXNQ16595 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
FXNQ16595 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
FXNQ16595 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
FXNQ16595 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FXNQ16595 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FXNQ16595 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
FXNQ16595 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FXNQ16595 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FXNQ16595 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FXNQ16595 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FXNQ16595 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FXNQ16595 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
FXNQ16595 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FXNQ16595 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FXNQ16595 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FXNQ16595 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
FXNQ16595 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FXNQ16595 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
FXNQ16595 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
FXNQ16595 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FXNQ16595 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FXNQ16595 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
FXNQ16595 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
FXNQ16595 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FXNQ16595 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
FXNQ16595 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
FXNQ16595 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
FXNQ16595 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FXNQ16595 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FXNQ16595 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FXNQ16595 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FXNQ16595 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
FXNQ16595 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
FXNQ16595 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
FXNQ16595 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
FXNQ16595 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
FXNQ16595 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
FXNQ16595 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
FXNQ16595 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
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FXNQ16595 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
FXNQ16595 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FXNQ16595 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FXNQ16595 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FXNQ16595 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FXNQ16595 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
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FXNQ16595 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
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FXNQ16595 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FXNQ16595 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
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FXNQ16595 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
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FXNQ16595 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FXNQ16595 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FXNQ16595 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FXNQ16595 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FXNQ16595 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FXNQ16595 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FXNQ16595 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FXNQ16595 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FXNQ16595 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FXNQ16595 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FXNQ16595 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FXNQ16595 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
FXNQ16595 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
FXNQ16595 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
FXNQ16595 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
FXNQ16595 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
FXNQ16595 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
FXNQ16595 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
FXNQ16595 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
FXNQ16595 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
FXNQ16595 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
FXNQ16595 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FXNQ16595 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
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