Protein–RNA interactions for Protein: Q16531

DDB1, DNA damage-binding protein 1, humanhuman

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Length 1,140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB1Q16531 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
DDB1Q16531 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
DDB1Q16531 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC30.91■■■□□ 2.54
DDB1Q16531 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
DDB1Q16531 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
DDB1Q16531 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC30.9■■■□□ 2.54
DDB1Q16531 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
DDB1Q16531 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
DDB1Q16531 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC30.9■■■□□ 2.54
DDB1Q16531 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
DDB1Q16531 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
DDB1Q16531 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
DDB1Q16531 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
DDB1Q16531 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC30.89■■■□□ 2.54
DDB1Q16531 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
DDB1Q16531 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
DDB1Q16531 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
DDB1Q16531 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
DDB1Q16531 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
DDB1Q16531 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
DDB1Q16531 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
DDB1Q16531 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
DDB1Q16531 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
DDB1Q16531 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
DDB1Q16531 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
DDB1Q16531 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
DDB1Q16531 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.87■■■□□ 2.53
DDB1Q16531 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
DDB1Q16531 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
DDB1Q16531 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
DDB1Q16531 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
DDB1Q16531 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
DDB1Q16531 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
DDB1Q16531 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
DDB1Q16531 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
DDB1Q16531 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC30.85■■■□□ 2.53
DDB1Q16531 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC30.85■■■□□ 2.53
DDB1Q16531 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
DDB1Q16531 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC30.84■■■□□ 2.53
DDB1Q16531 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
DDB1Q16531 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC30.84■■■□□ 2.53
DDB1Q16531 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC30.84■■■□□ 2.53
DDB1Q16531 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
DDB1Q16531 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
DDB1Q16531 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC30.83■■■□□ 2.53
DDB1Q16531 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
DDB1Q16531 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
DDB1Q16531 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
DDB1Q16531 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
DDB1Q16531 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
DDB1Q16531 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
DDB1Q16531 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
DDB1Q16531 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC30.82■■■□□ 2.52
DDB1Q16531 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
DDB1Q16531 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
DDB1Q16531 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.81■■■□□ 2.52
DDB1Q16531 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
DDB1Q16531 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
DDB1Q16531 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
DDB1Q16531 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
DDB1Q16531 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
DDB1Q16531 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
DDB1Q16531 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
DDB1Q16531 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
DDB1Q16531 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
DDB1Q16531 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
DDB1Q16531 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
DDB1Q16531 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
DDB1Q16531 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
DDB1Q16531 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
DDB1Q16531 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
DDB1Q16531 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
DDB1Q16531 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
DDB1Q16531 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
DDB1Q16531 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC30.77■■■□□ 2.52
DDB1Q16531 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
DDB1Q16531 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
DDB1Q16531 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.51
DDB1Q16531 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.51
DDB1Q16531 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
DDB1Q16531 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
DDB1Q16531 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC30.75■■■□□ 2.51
DDB1Q16531 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
DDB1Q16531 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
DDB1Q16531 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
DDB1Q16531 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC30.74■■■□□ 2.51
DDB1Q16531 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC30.73■■■□□ 2.51
DDB1Q16531 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC30.73■■■□□ 2.51
DDB1Q16531 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
DDB1Q16531 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
DDB1Q16531 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
DDB1Q16531 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
DDB1Q16531 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
DDB1Q16531 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC30.72■■■□□ 2.51
DDB1Q16531 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC30.72■■■□□ 2.51
DDB1Q16531 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
DDB1Q16531 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC30.72■■■□□ 2.51
DDB1Q16531 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
DDB1Q16531 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
DDB1Q16531 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
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