Protein–RNA interactions for Protein: Q16445

GABRA6, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-6, humanhuman

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Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA6Q16445 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GABRA6Q16445 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GABRA6Q16445 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GABRA6Q16445 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GABRA6Q16445 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GABRA6Q16445 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GABRA6Q16445 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GABRA6Q16445 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
GABRA6Q16445 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GABRA6Q16445 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GABRA6Q16445 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GABRA6Q16445 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GABRA6Q16445 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GABRA6Q16445 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GABRA6Q16445 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GABRA6Q16445 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
GABRA6Q16445 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GABRA6Q16445 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GABRA6Q16445 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GABRA6Q16445 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GABRA6Q16445 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GABRA6Q16445 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GABRA6Q16445 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GABRA6Q16445 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GABRA6Q16445 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GABRA6Q16445 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GABRA6Q16445 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GABRA6Q16445 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GABRA6Q16445 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GABRA6Q16445 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GABRA6Q16445 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GABRA6Q16445 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GABRA6Q16445 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GABRA6Q16445 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GABRA6Q16445 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GABRA6Q16445 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GABRA6Q16445 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GABRA6Q16445 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GABRA6Q16445 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GABRA6Q16445 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GABRA6Q16445 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GABRA6Q16445 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GABRA6Q16445 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GABRA6Q16445 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GABRA6Q16445 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GABRA6Q16445 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GABRA6Q16445 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
GABRA6Q16445 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GABRA6Q16445 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GABRA6Q16445 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GABRA6Q16445 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GABRA6Q16445 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GABRA6Q16445 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GABRA6Q16445 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GABRA6Q16445 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GABRA6Q16445 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GABRA6Q16445 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GABRA6Q16445 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GABRA6Q16445 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GABRA6Q16445 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GABRA6Q16445 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GABRA6Q16445 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GABRA6Q16445 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GABRA6Q16445 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GABRA6Q16445 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GABRA6Q16445 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GABRA6Q16445 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GABRA6Q16445 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GABRA6Q16445 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GABRA6Q16445 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GABRA6Q16445 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GABRA6Q16445 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GABRA6Q16445 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GABRA6Q16445 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GABRA6Q16445 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GABRA6Q16445 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GABRA6Q16445 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GABRA6Q16445 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
GABRA6Q16445 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GABRA6Q16445 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GABRA6Q16445 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GABRA6Q16445 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GABRA6Q16445 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GABRA6Q16445 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GABRA6Q16445 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GABRA6Q16445 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GABRA6Q16445 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GABRA6Q16445 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
GABRA6Q16445 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GABRA6Q16445 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GABRA6Q16445 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GABRA6Q16445 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GABRA6Q16445 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GABRA6Q16445 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GABRA6Q16445 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GABRA6Q16445 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GABRA6Q16445 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GABRA6Q16445 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GABRA6Q16445 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GABRA6Q16445 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
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