Protein–RNA interactions for Protein: Q16384

SSX1, Protein SSX1, humanhuman

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Length 188 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX1Q16384 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SSX1Q16384 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SSX1Q16384 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SSX1Q16384 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SSX1Q16384 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
SSX1Q16384 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SSX1Q16384 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SSX1Q16384 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SSX1Q16384 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SSX1Q16384 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SSX1Q16384 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SSX1Q16384 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SSX1Q16384 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
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SSX1Q16384 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SSX1Q16384 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SSX1Q16384 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SSX1Q16384 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SSX1Q16384 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SSX1Q16384 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SSX1Q16384 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SSX1Q16384 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SSX1Q16384 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SSX1Q16384 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SSX1Q16384 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SSX1Q16384 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SSX1Q16384 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SSX1Q16384 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
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SSX1Q16384 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
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SSX1Q16384 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SSX1Q16384 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SSX1Q16384 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SSX1Q16384 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
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SSX1Q16384 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
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SSX1Q16384 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SSX1Q16384 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
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SSX1Q16384 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
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SSX1Q16384 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SSX1Q16384 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SSX1Q16384 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
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SSX1Q16384 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SSX1Q16384 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SSX1Q16384 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SSX1Q16384 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SSX1Q16384 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SSX1Q16384 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SSX1Q16384 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SSX1Q16384 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SSX1Q16384 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SSX1Q16384 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SSX1Q16384 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SSX1Q16384 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SSX1Q16384 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SSX1Q16384 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SSX1Q16384 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SSX1Q16384 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
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