Protein–RNA interactions for Protein: Q15904

ATP6AP1, V-type proton ATPase subunit S1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6AP1Q15904 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATP6AP1Q15904 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATP6AP1Q15904 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATP6AP1Q15904 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATP6AP1Q15904 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATP6AP1Q15904 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATP6AP1Q15904 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATP6AP1Q15904 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATP6AP1Q15904 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
ATP6AP1Q15904 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATP6AP1Q15904 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATP6AP1Q15904 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATP6AP1Q15904 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATP6AP1Q15904 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATP6AP1Q15904 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATP6AP1Q15904 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATP6AP1Q15904 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATP6AP1Q15904 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATP6AP1Q15904 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATP6AP1Q15904 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATP6AP1Q15904 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATP6AP1Q15904 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATP6AP1Q15904 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATP6AP1Q15904 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATP6AP1Q15904 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATP6AP1Q15904 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATP6AP1Q15904 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
ATP6AP1Q15904 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATP6AP1Q15904 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATP6AP1Q15904 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATP6AP1Q15904 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATP6AP1Q15904 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATP6AP1Q15904 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATP6AP1Q15904 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATP6AP1Q15904 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATP6AP1Q15904 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATP6AP1Q15904 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATP6AP1Q15904 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATP6AP1Q15904 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATP6AP1Q15904 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATP6AP1Q15904 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATP6AP1Q15904 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATP6AP1Q15904 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATP6AP1Q15904 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATP6AP1Q15904 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATP6AP1Q15904 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATP6AP1Q15904 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATP6AP1Q15904 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATP6AP1Q15904 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATP6AP1Q15904 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATP6AP1Q15904 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATP6AP1Q15904 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
ATP6AP1Q15904 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATP6AP1Q15904 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATP6AP1Q15904 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATP6AP1Q15904 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATP6AP1Q15904 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATP6AP1Q15904 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATP6AP1Q15904 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATP6AP1Q15904 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATP6AP1Q15904 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATP6AP1Q15904 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATP6AP1Q15904 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
ATP6AP1Q15904 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATP6AP1Q15904 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATP6AP1Q15904 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATP6AP1Q15904 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATP6AP1Q15904 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATP6AP1Q15904 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATP6AP1Q15904 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATP6AP1Q15904 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATP6AP1Q15904 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATP6AP1Q15904 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
ATP6AP1Q15904 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATP6AP1Q15904 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATP6AP1Q15904 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATP6AP1Q15904 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATP6AP1Q15904 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATP6AP1Q15904 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATP6AP1Q15904 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATP6AP1Q15904 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATP6AP1Q15904 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATP6AP1Q15904 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATP6AP1Q15904 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATP6AP1Q15904 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATP6AP1Q15904 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATP6AP1Q15904 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATP6AP1Q15904 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATP6AP1Q15904 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATP6AP1Q15904 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATP6AP1Q15904 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ATP6AP1Q15904 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ATP6AP1Q15904 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
ATP6AP1Q15904 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ATP6AP1Q15904 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ATP6AP1Q15904 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ATP6AP1Q15904 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ATP6AP1Q15904 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ATP6AP1Q15904 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ATP6AP1Q15904 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
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