Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC85BQ15834 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC85BQ15834 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC85BQ15834 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC85BQ15834 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC85BQ15834 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC85BQ15834 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC85BQ15834 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC85BQ15834 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC85BQ15834 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC85BQ15834 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC85BQ15834 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC85BQ15834 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC85BQ15834 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC85BQ15834 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC85BQ15834 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC85BQ15834 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC85BQ15834 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC85BQ15834 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC85BQ15834 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC85BQ15834 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC85BQ15834 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC85BQ15834 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC85BQ15834 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC85BQ15834 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC85BQ15834 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC85BQ15834 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC85BQ15834 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC85BQ15834 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC85BQ15834 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC85BQ15834 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC85BQ15834 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC85BQ15834 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC85BQ15834 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC85BQ15834 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC85BQ15834 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC85BQ15834 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC85BQ15834 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC85BQ15834 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC85BQ15834 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC85BQ15834 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC85BQ15834 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC85BQ15834 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC85BQ15834 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
CCDC85BQ15834 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CCDC85BQ15834 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CCDC85BQ15834 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC85BQ15834 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC85BQ15834 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC85BQ15834 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC85BQ15834 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC85BQ15834 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC85BQ15834 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC85BQ15834 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC85BQ15834 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC85BQ15834 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC85BQ15834 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC85BQ15834 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC85BQ15834 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC85BQ15834 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC85BQ15834 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC85BQ15834 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC85BQ15834 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC85BQ15834 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC85BQ15834 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC85BQ15834 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC85BQ15834 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC85BQ15834 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC85BQ15834 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC85BQ15834 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC85BQ15834 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC85BQ15834 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC85BQ15834 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC85BQ15834 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC85BQ15834 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC85BQ15834 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC85BQ15834 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC85BQ15834 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC85BQ15834 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC85BQ15834 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC85BQ15834 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC85BQ15834 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC85BQ15834 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC85BQ15834 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC85BQ15834 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC85BQ15834 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC85BQ15834 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC85BQ15834 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC85BQ15834 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC85BQ15834 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC85BQ15834 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC85BQ15834 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC85BQ15834 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC85BQ15834 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC85BQ15834 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC85BQ15834 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC85BQ15834 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC85BQ15834 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC85BQ15834 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC85BQ15834 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
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