Protein–RNA interactions for Protein: Q15642

TRIP10, Cdc42-interacting protein 4, humanhuman

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Length 601 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP10Q15642 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIP10Q15642 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIP10Q15642 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIP10Q15642 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIP10Q15642 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIP10Q15642 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIP10Q15642 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIP10Q15642 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIP10Q15642 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIP10Q15642 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIP10Q15642 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIP10Q15642 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIP10Q15642 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TRIP10Q15642 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TRIP10Q15642 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TRIP10Q15642 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TRIP10Q15642 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TRIP10Q15642 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIP10Q15642 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIP10Q15642 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIP10Q15642 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIP10Q15642 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIP10Q15642 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIP10Q15642 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIP10Q15642 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIP10Q15642 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIP10Q15642 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIP10Q15642 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIP10Q15642 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIP10Q15642 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIP10Q15642 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIP10Q15642 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIP10Q15642 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIP10Q15642 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIP10Q15642 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIP10Q15642 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIP10Q15642 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIP10Q15642 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIP10Q15642 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIP10Q15642 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIP10Q15642 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIP10Q15642 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIP10Q15642 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIP10Q15642 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIP10Q15642 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIP10Q15642 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIP10Q15642 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIP10Q15642 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIP10Q15642 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIP10Q15642 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIP10Q15642 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIP10Q15642 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIP10Q15642 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIP10Q15642 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIP10Q15642 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIP10Q15642 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIP10Q15642 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIP10Q15642 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIP10Q15642 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIP10Q15642 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIP10Q15642 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIP10Q15642 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIP10Q15642 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIP10Q15642 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIP10Q15642 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIP10Q15642 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIP10Q15642 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIP10Q15642 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIP10Q15642 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIP10Q15642 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIP10Q15642 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIP10Q15642 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIP10Q15642 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIP10Q15642 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIP10Q15642 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIP10Q15642 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIP10Q15642 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TRIP10Q15642 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TRIP10Q15642 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TRIP10Q15642 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIP10Q15642 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIP10Q15642 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIP10Q15642 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIP10Q15642 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIP10Q15642 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIP10Q15642 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIP10Q15642 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIP10Q15642 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIP10Q15642 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIP10Q15642 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIP10Q15642 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIP10Q15642 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIP10Q15642 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIP10Q15642 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIP10Q15642 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIP10Q15642 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIP10Q15642 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIP10Q15642 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIP10Q15642 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIP10Q15642 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
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