Protein–RNA interactions for Protein: Q15436

SEC23A, Protein transport protein Sec23A, humanhuman

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Length 765 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23AQ15436 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SEC23AQ15436 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SEC23AQ15436 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SEC23AQ15436 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SEC23AQ15436 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SEC23AQ15436 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SEC23AQ15436 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SEC23AQ15436 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SEC23AQ15436 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SEC23AQ15436 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SEC23AQ15436 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SEC23AQ15436 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SEC23AQ15436 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SEC23AQ15436 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SEC23AQ15436 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SEC23AQ15436 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SEC23AQ15436 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SEC23AQ15436 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SEC23AQ15436 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
SEC23AQ15436 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SEC23AQ15436 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SEC23AQ15436 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SEC23AQ15436 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SEC23AQ15436 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SEC23AQ15436 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SEC23AQ15436 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SEC23AQ15436 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SEC23AQ15436 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SEC23AQ15436 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SEC23AQ15436 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SEC23AQ15436 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SEC23AQ15436 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
SEC23AQ15436 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
SEC23AQ15436 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SEC23AQ15436 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SEC23AQ15436 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
SEC23AQ15436 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SEC23AQ15436 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SEC23AQ15436 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SEC23AQ15436 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SEC23AQ15436 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SEC23AQ15436 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SEC23AQ15436 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SEC23AQ15436 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SEC23AQ15436 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SEC23AQ15436 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SEC23AQ15436 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SEC23AQ15436 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SEC23AQ15436 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SEC23AQ15436 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SEC23AQ15436 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SEC23AQ15436 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
SEC23AQ15436 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SEC23AQ15436 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SEC23AQ15436 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SEC23AQ15436 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SEC23AQ15436 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SEC23AQ15436 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SEC23AQ15436 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SEC23AQ15436 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SEC23AQ15436 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SEC23AQ15436 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SEC23AQ15436 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SEC23AQ15436 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SEC23AQ15436 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SEC23AQ15436 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SEC23AQ15436 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SEC23AQ15436 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SEC23AQ15436 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SEC23AQ15436 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
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SEC23AQ15436 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SEC23AQ15436 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
SEC23AQ15436 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SEC23AQ15436 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SEC23AQ15436 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SEC23AQ15436 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SEC23AQ15436 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SEC23AQ15436 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SEC23AQ15436 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SEC23AQ15436 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SEC23AQ15436 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SEC23AQ15436 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SEC23AQ15436 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SEC23AQ15436 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
SEC23AQ15436 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
SEC23AQ15436 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SEC23AQ15436 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SEC23AQ15436 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SEC23AQ15436 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SEC23AQ15436 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SEC23AQ15436 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SEC23AQ15436 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SEC23AQ15436 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SEC23AQ15436 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SEC23AQ15436 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SEC23AQ15436 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SEC23AQ15436 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SEC23AQ15436 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
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