Protein–RNA interactions for Protein: Q15397

PUM3, Pumilio homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM3Q15397 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
PUM3Q15397 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PUM3Q15397 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PUM3Q15397 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PUM3Q15397 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
PUM3Q15397 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
PUM3Q15397 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
PUM3Q15397 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
PUM3Q15397 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PUM3Q15397 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
PUM3Q15397 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
PUM3Q15397 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PUM3Q15397 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PUM3Q15397 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
PUM3Q15397 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PUM3Q15397 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PUM3Q15397 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
PUM3Q15397 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
PUM3Q15397 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
PUM3Q15397 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
PUM3Q15397 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
PUM3Q15397 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PUM3Q15397 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
PUM3Q15397 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PUM3Q15397 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PUM3Q15397 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
PUM3Q15397 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
PUM3Q15397 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
PUM3Q15397 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
PUM3Q15397 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
PUM3Q15397 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC28.64■■■□□ 2.18
PUM3Q15397 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.17
PUM3Q15397 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.17
PUM3Q15397 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PUM3Q15397 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PUM3Q15397 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PUM3Q15397 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PUM3Q15397 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
PUM3Q15397 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
PUM3Q15397 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
PUM3Q15397 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PUM3Q15397 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PUM3Q15397 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
PUM3Q15397 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
PUM3Q15397 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
PUM3Q15397 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
PUM3Q15397 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
PUM3Q15397 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PUM3Q15397 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PUM3Q15397 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PUM3Q15397 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PUM3Q15397 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
PUM3Q15397 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PUM3Q15397 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PUM3Q15397 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PUM3Q15397 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PUM3Q15397 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PUM3Q15397 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PUM3Q15397 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PUM3Q15397 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PUM3Q15397 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PUM3Q15397 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
PUM3Q15397 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PUM3Q15397 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
PUM3Q15397 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
PUM3Q15397 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PUM3Q15397 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PUM3Q15397 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PUM3Q15397 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PUM3Q15397 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
PUM3Q15397 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PUM3Q15397 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PUM3Q15397 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PUM3Q15397 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PUM3Q15397 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PUM3Q15397 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PUM3Q15397 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PUM3Q15397 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PUM3Q15397 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PUM3Q15397 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PUM3Q15397 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
PUM3Q15397 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PUM3Q15397 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PUM3Q15397 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PUM3Q15397 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PUM3Q15397 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PUM3Q15397 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PUM3Q15397 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PUM3Q15397 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PUM3Q15397 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PUM3Q15397 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PUM3Q15397 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
PUM3Q15397 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PUM3Q15397 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PUM3Q15397 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PUM3Q15397 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
PUM3Q15397 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
PUM3Q15397 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
PUM3Q15397 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
PUM3Q15397 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
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