Protein–RNA interactions for Protein: Q15008

PSMD6, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD6Q15008 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PSMD6Q15008 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PSMD6Q15008 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PSMD6Q15008 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PSMD6Q15008 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PSMD6Q15008 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PSMD6Q15008 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PSMD6Q15008 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PSMD6Q15008 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PSMD6Q15008 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PSMD6Q15008 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PSMD6Q15008 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PSMD6Q15008 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PSMD6Q15008 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
PSMD6Q15008 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PSMD6Q15008 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PSMD6Q15008 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PSMD6Q15008 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PSMD6Q15008 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PSMD6Q15008 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PSMD6Q15008 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PSMD6Q15008 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PSMD6Q15008 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PSMD6Q15008 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PSMD6Q15008 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PSMD6Q15008 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PSMD6Q15008 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PSMD6Q15008 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PSMD6Q15008 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PSMD6Q15008 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
PSMD6Q15008 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PSMD6Q15008 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PSMD6Q15008 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PSMD6Q15008 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PSMD6Q15008 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PSMD6Q15008 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PSMD6Q15008 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
PSMD6Q15008 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PSMD6Q15008 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PSMD6Q15008 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PSMD6Q15008 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PSMD6Q15008 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PSMD6Q15008 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PSMD6Q15008 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PSMD6Q15008 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PSMD6Q15008 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PSMD6Q15008 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PSMD6Q15008 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PSMD6Q15008 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PSMD6Q15008 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PSMD6Q15008 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PSMD6Q15008 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PSMD6Q15008 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PSMD6Q15008 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PSMD6Q15008 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
PSMD6Q15008 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PSMD6Q15008 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PSMD6Q15008 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PSMD6Q15008 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PSMD6Q15008 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PSMD6Q15008 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PSMD6Q15008 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PSMD6Q15008 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PSMD6Q15008 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PSMD6Q15008 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PSMD6Q15008 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PSMD6Q15008 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PSMD6Q15008 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PSMD6Q15008 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
PSMD6Q15008 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PSMD6Q15008 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PSMD6Q15008 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PSMD6Q15008 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PSMD6Q15008 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PSMD6Q15008 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PSMD6Q15008 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PSMD6Q15008 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PSMD6Q15008 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PSMD6Q15008 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PSMD6Q15008 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PSMD6Q15008 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PSMD6Q15008 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PSMD6Q15008 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PSMD6Q15008 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
PSMD6Q15008 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PSMD6Q15008 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PSMD6Q15008 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PSMD6Q15008 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PSMD6Q15008 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PSMD6Q15008 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PSMD6Q15008 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PSMD6Q15008 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PSMD6Q15008 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PSMD6Q15008 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PSMD6Q15008 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PSMD6Q15008 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
PSMD6Q15008 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PSMD6Q15008 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PSMD6Q15008 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PSMD6Q15008 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
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