Protein–RNA interactions for Protein: Q15004

PCLAF, PCNA-associated factor, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCLAFQ15004 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PCLAFQ15004 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PCLAFQ15004 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PCLAFQ15004 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
PCLAFQ15004 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PCLAFQ15004 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PCLAFQ15004 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PCLAFQ15004 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PCLAFQ15004 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23■■□□□ 1.27
PCLAFQ15004 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23■■□□□ 1.27
PCLAFQ15004 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PCLAFQ15004 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PCLAFQ15004 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PCLAFQ15004 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PCLAFQ15004 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PCLAFQ15004 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PCLAFQ15004 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PCLAFQ15004 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PCLAFQ15004 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PCLAFQ15004 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PCLAFQ15004 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PCLAFQ15004 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PCLAFQ15004 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PCLAFQ15004 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PCLAFQ15004 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PCLAFQ15004 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PCLAFQ15004 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PCLAFQ15004 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PCLAFQ15004 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PCLAFQ15004 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PCLAFQ15004 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PCLAFQ15004 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PCLAFQ15004 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PCLAFQ15004 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PCLAFQ15004 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PCLAFQ15004 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PCLAFQ15004 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PCLAFQ15004 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PCLAFQ15004 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PCLAFQ15004 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
PCLAFQ15004 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PCLAFQ15004 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PCLAFQ15004 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PCLAFQ15004 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PCLAFQ15004 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PCLAFQ15004 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PCLAFQ15004 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PCLAFQ15004 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PCLAFQ15004 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PCLAFQ15004 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PCLAFQ15004 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PCLAFQ15004 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PCLAFQ15004 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PCLAFQ15004 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PCLAFQ15004 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
PCLAFQ15004 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PCLAFQ15004 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PCLAFQ15004 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PCLAFQ15004 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PCLAFQ15004 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PCLAFQ15004 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PCLAFQ15004 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PCLAFQ15004 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PCLAFQ15004 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PCLAFQ15004 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PCLAFQ15004 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PCLAFQ15004 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PCLAFQ15004 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PCLAFQ15004 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PCLAFQ15004 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PCLAFQ15004 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PCLAFQ15004 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PCLAFQ15004 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PCLAFQ15004 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PCLAFQ15004 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PCLAFQ15004 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PCLAFQ15004 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PCLAFQ15004 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PCLAFQ15004 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PCLAFQ15004 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PCLAFQ15004 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PCLAFQ15004 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PCLAFQ15004 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PCLAFQ15004 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PCLAFQ15004 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PCLAFQ15004 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PCLAFQ15004 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PCLAFQ15004 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PCLAFQ15004 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PCLAFQ15004 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PCLAFQ15004 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PCLAFQ15004 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PCLAFQ15004 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PCLAFQ15004 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PCLAFQ15004 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PCLAFQ15004 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PCLAFQ15004 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PCLAFQ15004 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PCLAFQ15004 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PCLAFQ15004 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
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