Protein–RNA interactions for Protein: Q14964

RAB39A, Ras-related protein Rab-39A, humanhuman

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Length 217 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB39AQ14964 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAB39AQ14964 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAB39AQ14964 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAB39AQ14964 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAB39AQ14964 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAB39AQ14964 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAB39AQ14964 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAB39AQ14964 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAB39AQ14964 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAB39AQ14964 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAB39AQ14964 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAB39AQ14964 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAB39AQ14964 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAB39AQ14964 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAB39AQ14964 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RAB39AQ14964 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RAB39AQ14964 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RAB39AQ14964 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RAB39AQ14964 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
RAB39AQ14964 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RAB39AQ14964 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RAB39AQ14964 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
RAB39AQ14964 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RAB39AQ14964 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RAB39AQ14964 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAB39AQ14964 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
RAB39AQ14964 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
RAB39AQ14964 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
RAB39AQ14964 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
RAB39AQ14964 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAB39AQ14964 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAB39AQ14964 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAB39AQ14964 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAB39AQ14964 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RAB39AQ14964 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RAB39AQ14964 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RAB39AQ14964 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RAB39AQ14964 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
RAB39AQ14964 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RAB39AQ14964 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RAB39AQ14964 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RAB39AQ14964 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RAB39AQ14964 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RAB39AQ14964 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RAB39AQ14964 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RAB39AQ14964 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
RAB39AQ14964 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RAB39AQ14964 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RAB39AQ14964 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
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RAB39AQ14964 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RAB39AQ14964 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RAB39AQ14964 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RAB39AQ14964 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
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RAB39AQ14964 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RAB39AQ14964 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RAB39AQ14964 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
RAB39AQ14964 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RAB39AQ14964 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RAB39AQ14964 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RAB39AQ14964 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RAB39AQ14964 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RAB39AQ14964 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RAB39AQ14964 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
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RAB39AQ14964 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RAB39AQ14964 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RAB39AQ14964 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RAB39AQ14964 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RAB39AQ14964 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RAB39AQ14964 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
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RAB39AQ14964 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RAB39AQ14964 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RAB39AQ14964 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RAB39AQ14964 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RAB39AQ14964 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RAB39AQ14964 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RAB39AQ14964 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RAB39AQ14964 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RAB39AQ14964 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RAB39AQ14964 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RAB39AQ14964 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RAB39AQ14964 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RAB39AQ14964 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RAB39AQ14964 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
RAB39AQ14964 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RAB39AQ14964 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RAB39AQ14964 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RAB39AQ14964 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RAB39AQ14964 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RAB39AQ14964 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RAB39AQ14964 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RAB39AQ14964 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RAB39AQ14964 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RAB39AQ14964 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
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