Protein–RNA interactions for Protein: Q14938

NFIX, Nuclear factor 1 X-type, humanhuman

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Length 502 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIXQ14938 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
NFIXQ14938 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
NFIXQ14938 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
NFIXQ14938 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
NFIXQ14938 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
NFIXQ14938 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
NFIXQ14938 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
NFIXQ14938 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
NFIXQ14938 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
NFIXQ14938 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
NFIXQ14938 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
NFIXQ14938 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
NFIXQ14938 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
NFIXQ14938 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
NFIXQ14938 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
NFIXQ14938 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
NFIXQ14938 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
NFIXQ14938 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
NFIXQ14938 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC29.51■■■□□ 2.31
NFIXQ14938 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
NFIXQ14938 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
NFIXQ14938 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
NFIXQ14938 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
NFIXQ14938 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
NFIXQ14938 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
NFIXQ14938 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
NFIXQ14938 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
NFIXQ14938 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
NFIXQ14938 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
NFIXQ14938 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
NFIXQ14938 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
NFIXQ14938 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
NFIXQ14938 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
NFIXQ14938 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
NFIXQ14938 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
NFIXQ14938 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
NFIXQ14938 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
NFIXQ14938 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
NFIXQ14938 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
NFIXQ14938 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
NFIXQ14938 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
NFIXQ14938 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
NFIXQ14938 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
NFIXQ14938 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
NFIXQ14938 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
NFIXQ14938 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
NFIXQ14938 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
NFIXQ14938 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
NFIXQ14938 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
NFIXQ14938 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
NFIXQ14938 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
NFIXQ14938 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
NFIXQ14938 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
NFIXQ14938 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
NFIXQ14938 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
NFIXQ14938 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
NFIXQ14938 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
NFIXQ14938 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
NFIXQ14938 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
NFIXQ14938 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
NFIXQ14938 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
NFIXQ14938 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
NFIXQ14938 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
NFIXQ14938 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
NFIXQ14938 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
NFIXQ14938 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
NFIXQ14938 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
NFIXQ14938 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
NFIXQ14938 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
NFIXQ14938 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
NFIXQ14938 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
NFIXQ14938 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
NFIXQ14938 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
NFIXQ14938 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
NFIXQ14938 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
NFIXQ14938 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
NFIXQ14938 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
NFIXQ14938 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
NFIXQ14938 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
NFIXQ14938 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
NFIXQ14938 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
NFIXQ14938 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
NFIXQ14938 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
NFIXQ14938 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
NFIXQ14938 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
NFIXQ14938 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
NFIXQ14938 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
NFIXQ14938 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
NFIXQ14938 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
NFIXQ14938 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
NFIXQ14938 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
NFIXQ14938 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
NFIXQ14938 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
NFIXQ14938 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
NFIXQ14938 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
NFIXQ14938 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
NFIXQ14938 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
NFIXQ14938 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
NFIXQ14938 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
NFIXQ14938 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
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