Protein–RNA interactions for Protein: Q14574

DSC3, Desmocollin-3, humanhuman

Predictions only

Length 896 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC3Q14574 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
DSC3Q14574 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
DSC3Q14574 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
DSC3Q14574 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
DSC3Q14574 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
DSC3Q14574 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
DSC3Q14574 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
DSC3Q14574 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
DSC3Q14574 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
DSC3Q14574 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
DSC3Q14574 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
DSC3Q14574 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
DSC3Q14574 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
DSC3Q14574 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
DSC3Q14574 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
DSC3Q14574 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
DSC3Q14574 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
DSC3Q14574 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
DSC3Q14574 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
DSC3Q14574 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
DSC3Q14574 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
DSC3Q14574 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
DSC3Q14574 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
DSC3Q14574 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
DSC3Q14574 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
DSC3Q14574 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
DSC3Q14574 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
DSC3Q14574 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
DSC3Q14574 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
DSC3Q14574 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
DSC3Q14574 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
DSC3Q14574 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
DSC3Q14574 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
DSC3Q14574 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
DSC3Q14574 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
DSC3Q14574 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
DSC3Q14574 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
DSC3Q14574 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
DSC3Q14574 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
DSC3Q14574 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
DSC3Q14574 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
DSC3Q14574 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
DSC3Q14574 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
DSC3Q14574 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
DSC3Q14574 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
DSC3Q14574 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
DSC3Q14574 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
DSC3Q14574 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
DSC3Q14574 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
DSC3Q14574 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
DSC3Q14574 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
DSC3Q14574 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
DSC3Q14574 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
DSC3Q14574 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
DSC3Q14574 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
DSC3Q14574 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
DSC3Q14574 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
DSC3Q14574 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.66
DSC3Q14574 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.66
DSC3Q14574 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
DSC3Q14574 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
DSC3Q14574 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
DSC3Q14574 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
DSC3Q14574 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
DSC3Q14574 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
DSC3Q14574 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
DSC3Q14574 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
DSC3Q14574 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
DSC3Q14574 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
DSC3Q14574 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
DSC3Q14574 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
DSC3Q14574 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
DSC3Q14574 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
DSC3Q14574 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
DSC3Q14574 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
DSC3Q14574 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
DSC3Q14574 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
DSC3Q14574 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
DSC3Q14574 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
DSC3Q14574 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
DSC3Q14574 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
DSC3Q14574 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
DSC3Q14574 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
DSC3Q14574 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
DSC3Q14574 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
DSC3Q14574 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
DSC3Q14574 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
DSC3Q14574 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
DSC3Q14574 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
DSC3Q14574 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
DSC3Q14574 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
DSC3Q14574 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
DSC3Q14574 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
DSC3Q14574 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
DSC3Q14574 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
DSC3Q14574 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
DSC3Q14574 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
DSC3Q14574 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
DSC3Q14574 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
DSC3Q14574 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms