Protein–RNA interactions for Protein: Q14457

BECN1, Beclin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BECN1Q14457 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
BECN1Q14457 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
BECN1Q14457 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
BECN1Q14457 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
BECN1Q14457 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
BECN1Q14457 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
BECN1Q14457 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
BECN1Q14457 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
BECN1Q14457 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
BECN1Q14457 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
BECN1Q14457 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
BECN1Q14457 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
BECN1Q14457 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
BECN1Q14457 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
BECN1Q14457 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
BECN1Q14457 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
BECN1Q14457 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
BECN1Q14457 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
BECN1Q14457 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
BECN1Q14457 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
BECN1Q14457 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
BECN1Q14457 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
BECN1Q14457 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
BECN1Q14457 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
BECN1Q14457 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
BECN1Q14457 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
BECN1Q14457 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
BECN1Q14457 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
BECN1Q14457 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
BECN1Q14457 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
BECN1Q14457 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
BECN1Q14457 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
BECN1Q14457 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
BECN1Q14457 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
BECN1Q14457 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
BECN1Q14457 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
BECN1Q14457 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
BECN1Q14457 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
BECN1Q14457 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
BECN1Q14457 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
BECN1Q14457 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
BECN1Q14457 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
BECN1Q14457 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
BECN1Q14457 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
BECN1Q14457 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
BECN1Q14457 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
BECN1Q14457 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
BECN1Q14457 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
BECN1Q14457 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
BECN1Q14457 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
BECN1Q14457 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
BECN1Q14457 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
BECN1Q14457 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
BECN1Q14457 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
BECN1Q14457 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
BECN1Q14457 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
BECN1Q14457 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
BECN1Q14457 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
BECN1Q14457 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
BECN1Q14457 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
BECN1Q14457 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
BECN1Q14457 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
BECN1Q14457 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
BECN1Q14457 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
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BECN1Q14457 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
BECN1Q14457 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
BECN1Q14457 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
BECN1Q14457 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
BECN1Q14457 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
BECN1Q14457 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
BECN1Q14457 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
BECN1Q14457 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
BECN1Q14457 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
BECN1Q14457 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
BECN1Q14457 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
BECN1Q14457 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
BECN1Q14457 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
BECN1Q14457 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
BECN1Q14457 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
BECN1Q14457 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
BECN1Q14457 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
BECN1Q14457 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
BECN1Q14457 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
BECN1Q14457 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
BECN1Q14457 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
BECN1Q14457 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
BECN1Q14457 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
BECN1Q14457 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
BECN1Q14457 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
BECN1Q14457 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
BECN1Q14457 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
BECN1Q14457 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
BECN1Q14457 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
BECN1Q14457 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
BECN1Q14457 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
BECN1Q14457 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
BECN1Q14457 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
BECN1Q14457 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
BECN1Q14457 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
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