Protein–RNA interactions for Protein: Q14139

UBE4A, Ubiquitin conjugation factor E4 A, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE4AQ14139 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
UBE4AQ14139 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
UBE4AQ14139 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
UBE4AQ14139 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
UBE4AQ14139 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
UBE4AQ14139 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
UBE4AQ14139 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
UBE4AQ14139 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
UBE4AQ14139 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
UBE4AQ14139 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
UBE4AQ14139 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
UBE4AQ14139 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
UBE4AQ14139 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
UBE4AQ14139 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
UBE4AQ14139 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.17
UBE4AQ14139 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
UBE4AQ14139 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.17
UBE4AQ14139 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
UBE4AQ14139 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
UBE4AQ14139 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
UBE4AQ14139 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
UBE4AQ14139 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
UBE4AQ14139 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
UBE4AQ14139 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
UBE4AQ14139 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
UBE4AQ14139 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
UBE4AQ14139 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC28.62■■■□□ 2.17
UBE4AQ14139 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
UBE4AQ14139 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
UBE4AQ14139 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
UBE4AQ14139 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
UBE4AQ14139 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
UBE4AQ14139 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
UBE4AQ14139 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
UBE4AQ14139 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
UBE4AQ14139 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
UBE4AQ14139 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
UBE4AQ14139 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
UBE4AQ14139 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
UBE4AQ14139 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
UBE4AQ14139 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
UBE4AQ14139 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
UBE4AQ14139 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
UBE4AQ14139 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
UBE4AQ14139 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
UBE4AQ14139 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
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UBE4AQ14139 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
UBE4AQ14139 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
UBE4AQ14139 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
UBE4AQ14139 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
UBE4AQ14139 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
UBE4AQ14139 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
UBE4AQ14139 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
UBE4AQ14139 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
UBE4AQ14139 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
UBE4AQ14139 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
UBE4AQ14139 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
UBE4AQ14139 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
UBE4AQ14139 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
UBE4AQ14139 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
UBE4AQ14139 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
UBE4AQ14139 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
UBE4AQ14139 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
UBE4AQ14139 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
UBE4AQ14139 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
UBE4AQ14139 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
UBE4AQ14139 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
UBE4AQ14139 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
UBE4AQ14139 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
UBE4AQ14139 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
UBE4AQ14139 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
UBE4AQ14139 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
UBE4AQ14139 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
UBE4AQ14139 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
UBE4AQ14139 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
UBE4AQ14139 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
UBE4AQ14139 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
UBE4AQ14139 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
UBE4AQ14139 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
UBE4AQ14139 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
UBE4AQ14139 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
UBE4AQ14139 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
UBE4AQ14139 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
UBE4AQ14139 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
UBE4AQ14139 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
UBE4AQ14139 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
UBE4AQ14139 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
UBE4AQ14139 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
UBE4AQ14139 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
UBE4AQ14139 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
UBE4AQ14139 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
UBE4AQ14139 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
UBE4AQ14139 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
UBE4AQ14139 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
UBE4AQ14139 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
UBE4AQ14139 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
UBE4AQ14139 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC28.53■■■□□ 2.16
UBE4AQ14139 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
UBE4AQ14139 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
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