Protein–RNA interactions for Protein: Q13829

TNFAIP1, BTB/POZ domain-containing adapter for CUL3-mediated RhoA degradation protein 2, humanhuman

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Length 316 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFAIP1Q13829 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TNFAIP1Q13829 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
TNFAIP1Q13829 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
TNFAIP1Q13829 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
TNFAIP1Q13829 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TNFAIP1Q13829 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TNFAIP1Q13829 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TNFAIP1Q13829 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TNFAIP1Q13829 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TNFAIP1Q13829 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
TNFAIP1Q13829 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TNFAIP1Q13829 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TNFAIP1Q13829 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TNFAIP1Q13829 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
TNFAIP1Q13829 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TNFAIP1Q13829 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TNFAIP1Q13829 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
TNFAIP1Q13829 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
TNFAIP1Q13829 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
TNFAIP1Q13829 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TNFAIP1Q13829 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TNFAIP1Q13829 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TNFAIP1Q13829 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TNFAIP1Q13829 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TNFAIP1Q13829 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TNFAIP1Q13829 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TNFAIP1Q13829 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TNFAIP1Q13829 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
TNFAIP1Q13829 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TNFAIP1Q13829 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TNFAIP1Q13829 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TNFAIP1Q13829 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TNFAIP1Q13829 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TNFAIP1Q13829 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
TNFAIP1Q13829 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TNFAIP1Q13829 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
TNFAIP1Q13829 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TNFAIP1Q13829 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TNFAIP1Q13829 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TNFAIP1Q13829 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TNFAIP1Q13829 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TNFAIP1Q13829 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TNFAIP1Q13829 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
TNFAIP1Q13829 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
TNFAIP1Q13829 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
TNFAIP1Q13829 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
TNFAIP1Q13829 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TNFAIP1Q13829 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TNFAIP1Q13829 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
TNFAIP1Q13829 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
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TNFAIP1Q13829 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
TNFAIP1Q13829 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
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TNFAIP1Q13829 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
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TNFAIP1Q13829 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TNFAIP1Q13829 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TNFAIP1Q13829 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TNFAIP1Q13829 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TNFAIP1Q13829 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TNFAIP1Q13829 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
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TNFAIP1Q13829 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TNFAIP1Q13829 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
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TNFAIP1Q13829 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TNFAIP1Q13829 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
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TNFAIP1Q13829 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
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TNFAIP1Q13829 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TNFAIP1Q13829 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TNFAIP1Q13829 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TNFAIP1Q13829 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TNFAIP1Q13829 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TNFAIP1Q13829 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TNFAIP1Q13829 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TNFAIP1Q13829 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TNFAIP1Q13829 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TNFAIP1Q13829 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
TNFAIP1Q13829 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TNFAIP1Q13829 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TNFAIP1Q13829 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TNFAIP1Q13829 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TNFAIP1Q13829 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TNFAIP1Q13829 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TNFAIP1Q13829 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TNFAIP1Q13829 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TNFAIP1Q13829 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TNFAIP1Q13829 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
TNFAIP1Q13829 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
TNFAIP1Q13829 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
TNFAIP1Q13829 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
TNFAIP1Q13829 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
TNFAIP1Q13829 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
TNFAIP1Q13829 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
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