Protein–RNA interactions for Protein: Q13761

RUNX3, Runt-related transcription factor 3, humanhuman

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX3Q13761 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RUNX3Q13761 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RUNX3Q13761 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RUNX3Q13761 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RUNX3Q13761 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RUNX3Q13761 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RUNX3Q13761 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RUNX3Q13761 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
RUNX3Q13761 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RUNX3Q13761 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RUNX3Q13761 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RUNX3Q13761 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RUNX3Q13761 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RUNX3Q13761 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RUNX3Q13761 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RUNX3Q13761 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
RUNX3Q13761 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RUNX3Q13761 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
RUNX3Q13761 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
RUNX3Q13761 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
RUNX3Q13761 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RUNX3Q13761 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
RUNX3Q13761 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RUNX3Q13761 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RUNX3Q13761 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RUNX3Q13761 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RUNX3Q13761 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RUNX3Q13761 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RUNX3Q13761 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
RUNX3Q13761 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RUNX3Q13761 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RUNX3Q13761 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RUNX3Q13761 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
RUNX3Q13761 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RUNX3Q13761 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RUNX3Q13761 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RUNX3Q13761 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RUNX3Q13761 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RUNX3Q13761 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RUNX3Q13761 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RUNX3Q13761 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RUNX3Q13761 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RUNX3Q13761 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RUNX3Q13761 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RUNX3Q13761 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RUNX3Q13761 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RUNX3Q13761 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RUNX3Q13761 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RUNX3Q13761 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RUNX3Q13761 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RUNX3Q13761 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RUNX3Q13761 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RUNX3Q13761 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RUNX3Q13761 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RUNX3Q13761 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RUNX3Q13761 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RUNX3Q13761 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RUNX3Q13761 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RUNX3Q13761 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RUNX3Q13761 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RUNX3Q13761 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
RUNX3Q13761 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RUNX3Q13761 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RUNX3Q13761 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RUNX3Q13761 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RUNX3Q13761 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RUNX3Q13761 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RUNX3Q13761 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RUNX3Q13761 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RUNX3Q13761 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RUNX3Q13761 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RUNX3Q13761 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RUNX3Q13761 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RUNX3Q13761 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RUNX3Q13761 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RUNX3Q13761 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RUNX3Q13761 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RUNX3Q13761 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RUNX3Q13761 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RUNX3Q13761 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RUNX3Q13761 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RUNX3Q13761 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RUNX3Q13761 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RUNX3Q13761 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RUNX3Q13761 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
RUNX3Q13761 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
RUNX3Q13761 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RUNX3Q13761 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RUNX3Q13761 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
RUNX3Q13761 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
RUNX3Q13761 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
RUNX3Q13761 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RUNX3Q13761 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RUNX3Q13761 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
RUNX3Q13761 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RUNX3Q13761 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RUNX3Q13761 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RUNX3Q13761 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RUNX3Q13761 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RUNX3Q13761 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
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