Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC32.98■■■□□ 2.87
PTCH1Q13635 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
PTCH1Q13635 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
PTCH1Q13635 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
PTCH1Q13635 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC32.97■■■□□ 2.87
PTCH1Q13635 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
PTCH1Q13635 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC32.96■■■□□ 2.87
PTCH1Q13635 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
PTCH1Q13635 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
PTCH1Q13635 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
PTCH1Q13635 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
PTCH1Q13635 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
PTCH1Q13635 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
PTCH1Q13635 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.95■■■□□ 2.87
PTCH1Q13635 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
PTCH1Q13635 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.95■■■□□ 2.87
PTCH1Q13635 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
PTCH1Q13635 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.95■■■□□ 2.87
PTCH1Q13635 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
PTCH1Q13635 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.86
PTCH1Q13635 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.86
PTCH1Q13635 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.95■■■□□ 2.86
PTCH1Q13635 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC32.94■■■□□ 2.86
PTCH1Q13635 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC32.94■■■□□ 2.86
PTCH1Q13635 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.94■■■□□ 2.86
PTCH1Q13635 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
PTCH1Q13635 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC32.94■■■□□ 2.86
PTCH1Q13635 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC32.94■■■□□ 2.86
PTCH1Q13635 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
PTCH1Q13635 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
PTCH1Q13635 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC32.93■■■□□ 2.86
PTCH1Q13635 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC32.93■■■□□ 2.86
PTCH1Q13635 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
PTCH1Q13635 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.93■■■□□ 2.86
PTCH1Q13635 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC32.93■■■□□ 2.86
PTCH1Q13635 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC32.93■■■□□ 2.86
PTCH1Q13635 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.93■■■□□ 2.86
PTCH1Q13635 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
PTCH1Q13635 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC32.92■■■□□ 2.86
PTCH1Q13635 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC32.92■■■□□ 2.86
PTCH1Q13635 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
PTCH1Q13635 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
PTCH1Q13635 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC32.91■■■□□ 2.86
PTCH1Q13635 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
PTCH1Q13635 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.9■■■□□ 2.86
PTCH1Q13635 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.89■■■□□ 2.86
PTCH1Q13635 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
PTCH1Q13635 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
PTCH1Q13635 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
PTCH1Q13635 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
PTCH1Q13635 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
PTCH1Q13635 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC32.89■■■□□ 2.86
PTCH1Q13635 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
PTCH1Q13635 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC32.89■■■□□ 2.86
PTCH1Q13635 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.89■■■□□ 2.86
PTCH1Q13635 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC32.89■■■□□ 2.86
PTCH1Q13635 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
PTCH1Q13635 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
PTCH1Q13635 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC32.88■■■□□ 2.85
PTCH1Q13635 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
PTCH1Q13635 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
PTCH1Q13635 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
PTCH1Q13635 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC32.86■■■□□ 2.85
PTCH1Q13635 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
PTCH1Q13635 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC32.86■■■□□ 2.85
PTCH1Q13635 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC32.86■■■□□ 2.85
PTCH1Q13635 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
PTCH1Q13635 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
PTCH1Q13635 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.85■■■□□ 2.85
PTCH1Q13635 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC32.85■■■□□ 2.85
PTCH1Q13635 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC32.85■■■□□ 2.85
PTCH1Q13635 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
PTCH1Q13635 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
PTCH1Q13635 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC32.85■■■□□ 2.85
PTCH1Q13635 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
PTCH1Q13635 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
PTCH1Q13635 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC32.84■■■□□ 2.85
PTCH1Q13635 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC32.83■■■□□ 2.85
PTCH1Q13635 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC32.83■■■□□ 2.85
PTCH1Q13635 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
PTCH1Q13635 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.85
PTCH1Q13635 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
PTCH1Q13635 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
PTCH1Q13635 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
PTCH1Q13635 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
PTCH1Q13635 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC32.82■■■□□ 2.84
PTCH1Q13635 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC32.82■■■□□ 2.84
PTCH1Q13635 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
PTCH1Q13635 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
PTCH1Q13635 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
PTCH1Q13635 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.81■■■□□ 2.84
PTCH1Q13635 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC32.8■■■□□ 2.84
PTCH1Q13635 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
PTCH1Q13635 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC32.8■■■□□ 2.84
PTCH1Q13635 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC32.8■■■□□ 2.84
PTCH1Q13635 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC32.8■■■□□ 2.84
PTCH1Q13635 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
PTCH1Q13635 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC32.79■■■□□ 2.84
PTCH1Q13635 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC32.79■■■□□ 2.84
PTCH1Q13635 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
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