Protein–RNA interactions for Protein: Q13523

PRPF4B, Serine/threonine-protein kinase PRP4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,007 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF4BQ13523 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PRPF4BQ13523 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PRPF4BQ13523 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PRPF4BQ13523 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PRPF4BQ13523 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PRPF4BQ13523 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PRPF4BQ13523 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PRPF4BQ13523 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
PRPF4BQ13523 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PRPF4BQ13523 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PRPF4BQ13523 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PRPF4BQ13523 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PRPF4BQ13523 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PRPF4BQ13523 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
PRPF4BQ13523 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PRPF4BQ13523 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PRPF4BQ13523 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PRPF4BQ13523 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PRPF4BQ13523 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PRPF4BQ13523 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PRPF4BQ13523 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PRPF4BQ13523 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PRPF4BQ13523 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PRPF4BQ13523 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PRPF4BQ13523 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PRPF4BQ13523 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PRPF4BQ13523 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PRPF4BQ13523 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PRPF4BQ13523 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PRPF4BQ13523 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PRPF4BQ13523 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PRPF4BQ13523 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PRPF4BQ13523 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PRPF4BQ13523 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PRPF4BQ13523 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PRPF4BQ13523 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PRPF4BQ13523 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
PRPF4BQ13523 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PRPF4BQ13523 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PRPF4BQ13523 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
PRPF4BQ13523 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PRPF4BQ13523 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PRPF4BQ13523 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
PRPF4BQ13523 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PRPF4BQ13523 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
PRPF4BQ13523 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PRPF4BQ13523 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PRPF4BQ13523 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PRPF4BQ13523 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
PRPF4BQ13523 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PRPF4BQ13523 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PRPF4BQ13523 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PRPF4BQ13523 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PRPF4BQ13523 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PRPF4BQ13523 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PRPF4BQ13523 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
PRPF4BQ13523 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PRPF4BQ13523 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PRPF4BQ13523 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PRPF4BQ13523 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PRPF4BQ13523 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PRPF4BQ13523 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
PRPF4BQ13523 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PRPF4BQ13523 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PRPF4BQ13523 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PRPF4BQ13523 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PRPF4BQ13523 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PRPF4BQ13523 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PRPF4BQ13523 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PRPF4BQ13523 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PRPF4BQ13523 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PRPF4BQ13523 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PRPF4BQ13523 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PRPF4BQ13523 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PRPF4BQ13523 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PRPF4BQ13523 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PRPF4BQ13523 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PRPF4BQ13523 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PRPF4BQ13523 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PRPF4BQ13523 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
PRPF4BQ13523 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PRPF4BQ13523 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PRPF4BQ13523 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PRPF4BQ13523 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PRPF4BQ13523 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PRPF4BQ13523 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PRPF4BQ13523 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PRPF4BQ13523 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PRPF4BQ13523 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PRPF4BQ13523 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PRPF4BQ13523 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PRPF4BQ13523 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PRPF4BQ13523 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PRPF4BQ13523 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
PRPF4BQ13523 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PRPF4BQ13523 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PRPF4BQ13523 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PRPF4BQ13523 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PRPF4BQ13523 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PRPF4BQ13523 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
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