Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TOP3AQ13472 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TOP3AQ13472 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TOP3AQ13472 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TOP3AQ13472 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TOP3AQ13472 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TOP3AQ13472 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TOP3AQ13472 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TOP3AQ13472 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TOP3AQ13472 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TOP3AQ13472 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TOP3AQ13472 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TOP3AQ13472 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TOP3AQ13472 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TOP3AQ13472 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TOP3AQ13472 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TOP3AQ13472 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TOP3AQ13472 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TOP3AQ13472 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TOP3AQ13472 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TOP3AQ13472 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TOP3AQ13472 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TOP3AQ13472 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TOP3AQ13472 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TOP3AQ13472 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TOP3AQ13472 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TOP3AQ13472 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TOP3AQ13472 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TOP3AQ13472 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TOP3AQ13472 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TOP3AQ13472 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TOP3AQ13472 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TOP3AQ13472 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TOP3AQ13472 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TOP3AQ13472 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TOP3AQ13472 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TOP3AQ13472 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TOP3AQ13472 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TOP3AQ13472 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TOP3AQ13472 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TOP3AQ13472 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TOP3AQ13472 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TOP3AQ13472 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TOP3AQ13472 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TOP3AQ13472 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TOP3AQ13472 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TOP3AQ13472 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TOP3AQ13472 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TOP3AQ13472 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TOP3AQ13472 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TOP3AQ13472 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TOP3AQ13472 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TOP3AQ13472 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TOP3AQ13472 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TOP3AQ13472 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TOP3AQ13472 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TOP3AQ13472 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TOP3AQ13472 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TOP3AQ13472 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
TOP3AQ13472 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TOP3AQ13472 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TOP3AQ13472 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TOP3AQ13472 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TOP3AQ13472 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
TOP3AQ13472 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TOP3AQ13472 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TOP3AQ13472 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TOP3AQ13472 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TOP3AQ13472 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TOP3AQ13472 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TOP3AQ13472 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TOP3AQ13472 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TOP3AQ13472 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TOP3AQ13472 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
TOP3AQ13472 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TOP3AQ13472 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TOP3AQ13472 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TOP3AQ13472 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TOP3AQ13472 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TOP3AQ13472 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
TOP3AQ13472 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TOP3AQ13472 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TOP3AQ13472 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TOP3AQ13472 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TOP3AQ13472 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TOP3AQ13472 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TOP3AQ13472 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TOP3AQ13472 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TOP3AQ13472 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TOP3AQ13472 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TOP3AQ13472 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TOP3AQ13472 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TOP3AQ13472 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TOP3AQ13472 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TOP3AQ13472 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TOP3AQ13472 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TOP3AQ13472 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TOP3AQ13472 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TOP3AQ13472 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TOP3AQ13472 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
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