Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ITGB3BPQ13352 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ITGB3BPQ13352 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ITGB3BPQ13352 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ITGB3BPQ13352 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ITGB3BPQ13352 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ITGB3BPQ13352 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ITGB3BPQ13352 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ITGB3BPQ13352 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ITGB3BPQ13352 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ITGB3BPQ13352 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ITGB3BPQ13352 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ITGB3BPQ13352 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ITGB3BPQ13352 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ITGB3BPQ13352 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ITGB3BPQ13352 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ITGB3BPQ13352 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ITGB3BPQ13352 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
ITGB3BPQ13352 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ITGB3BPQ13352 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ITGB3BPQ13352 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ITGB3BPQ13352 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ITGB3BPQ13352 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
ITGB3BPQ13352 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
ITGB3BPQ13352 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
ITGB3BPQ13352 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ITGB3BPQ13352 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ITGB3BPQ13352 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ITGB3BPQ13352 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
ITGB3BPQ13352 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.8
ITGB3BPQ13352 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ITGB3BPQ13352 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ITGB3BPQ13352 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ITGB3BPQ13352 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ITGB3BPQ13352 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ITGB3BPQ13352 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ITGB3BPQ13352 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ITGB3BPQ13352 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ITGB3BPQ13352 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ITGB3BPQ13352 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ITGB3BPQ13352 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ITGB3BPQ13352 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ITGB3BPQ13352 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
ITGB3BPQ13352 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
ITGB3BPQ13352 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
ITGB3BPQ13352 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
ITGB3BPQ13352 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ITGB3BPQ13352 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
ITGB3BPQ13352 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ITGB3BPQ13352 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ITGB3BPQ13352 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ITGB3BPQ13352 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ITGB3BPQ13352 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ITGB3BPQ13352 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ITGB3BPQ13352 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ITGB3BPQ13352 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ITGB3BPQ13352 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ITGB3BPQ13352 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ITGB3BPQ13352 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ITGB3BPQ13352 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ITGB3BPQ13352 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
ITGB3BPQ13352 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
ITGB3BPQ13352 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ITGB3BPQ13352 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ITGB3BPQ13352 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ITGB3BPQ13352 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ITGB3BPQ13352 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ITGB3BPQ13352 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ITGB3BPQ13352 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ITGB3BPQ13352 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ITGB3BPQ13352 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ITGB3BPQ13352 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ITGB3BPQ13352 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ITGB3BPQ13352 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ITGB3BPQ13352 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ITGB3BPQ13352 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ITGB3BPQ13352 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ITGB3BPQ13352 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
ITGB3BPQ13352 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ITGB3BPQ13352 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ITGB3BPQ13352 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ITGB3BPQ13352 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ITGB3BPQ13352 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ITGB3BPQ13352 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ITGB3BPQ13352 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ITGB3BPQ13352 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ITGB3BPQ13352 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ITGB3BPQ13352 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ITGB3BPQ13352 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ITGB3BPQ13352 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ITGB3BPQ13352 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ITGB3BPQ13352 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ITGB3BPQ13352 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
ITGB3BPQ13352 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ITGB3BPQ13352 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ITGB3BPQ13352 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ITGB3BPQ13352 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ITGB3BPQ13352 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ITGB3BPQ13352 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ITGB3BPQ13352 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
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