Protein–RNA interactions for Protein: Q13247

SRSF6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF6Q13247 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SRSF6Q13247 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SRSF6Q13247 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SRSF6Q13247 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SRSF6Q13247 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SRSF6Q13247 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SRSF6Q13247 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SRSF6Q13247 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SRSF6Q13247 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SRSF6Q13247 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
SRSF6Q13247 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SRSF6Q13247 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SRSF6Q13247 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SRSF6Q13247 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
SRSF6Q13247 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SRSF6Q13247 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SRSF6Q13247 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
SRSF6Q13247 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
SRSF6Q13247 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SRSF6Q13247 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SRSF6Q13247 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
SRSF6Q13247 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
SRSF6Q13247 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SRSF6Q13247 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SRSF6Q13247 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
SRSF6Q13247 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SRSF6Q13247 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SRSF6Q13247 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SRSF6Q13247 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SRSF6Q13247 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SRSF6Q13247 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SRSF6Q13247 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SRSF6Q13247 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SRSF6Q13247 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SRSF6Q13247 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SRSF6Q13247 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SRSF6Q13247 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
SRSF6Q13247 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
SRSF6Q13247 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SRSF6Q13247 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SRSF6Q13247 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SRSF6Q13247 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SRSF6Q13247 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SRSF6Q13247 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SRSF6Q13247 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SRSF6Q13247 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SRSF6Q13247 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SRSF6Q13247 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SRSF6Q13247 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SRSF6Q13247 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SRSF6Q13247 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SRSF6Q13247 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SRSF6Q13247 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SRSF6Q13247 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SRSF6Q13247 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SRSF6Q13247 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SRSF6Q13247 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SRSF6Q13247 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SRSF6Q13247 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SRSF6Q13247 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SRSF6Q13247 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SRSF6Q13247 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SRSF6Q13247 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SRSF6Q13247 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
SRSF6Q13247 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SRSF6Q13247 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SRSF6Q13247 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SRSF6Q13247 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SRSF6Q13247 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SRSF6Q13247 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SRSF6Q13247 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SRSF6Q13247 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SRSF6Q13247 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SRSF6Q13247 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SRSF6Q13247 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SRSF6Q13247 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SRSF6Q13247 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
SRSF6Q13247 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SRSF6Q13247 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SRSF6Q13247 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SRSF6Q13247 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SRSF6Q13247 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SRSF6Q13247 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SRSF6Q13247 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SRSF6Q13247 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SRSF6Q13247 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SRSF6Q13247 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SRSF6Q13247 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SRSF6Q13247 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
SRSF6Q13247 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SRSF6Q13247 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
SRSF6Q13247 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SRSF6Q13247 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SRSF6Q13247 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SRSF6Q13247 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SRSF6Q13247 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
SRSF6Q13247 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SRSF6Q13247 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
SRSF6Q13247 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SRSF6Q13247 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
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