Protein–RNA interactions for Protein: Q13219

PAPPA, Pappalysin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,627 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAPPAQ13219 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
PAPPAQ13219 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
PAPPAQ13219 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC30.6■■■□□ 2.49
PAPPAQ13219 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
PAPPAQ13219 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
PAPPAQ13219 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC30.59■■■□□ 2.49
PAPPAQ13219 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
PAPPAQ13219 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC30.59■■■□□ 2.49
PAPPAQ13219 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC30.59■■■□□ 2.49
PAPPAQ13219 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
PAPPAQ13219 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
PAPPAQ13219 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
PAPPAQ13219 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
PAPPAQ13219 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
PAPPAQ13219 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
PAPPAQ13219 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC30.58■■■□□ 2.49
PAPPAQ13219 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
PAPPAQ13219 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
PAPPAQ13219 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
PAPPAQ13219 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC30.57■■■□□ 2.48
PAPPAQ13219 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
PAPPAQ13219 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC30.56■■■□□ 2.48
PAPPAQ13219 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
PAPPAQ13219 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
PAPPAQ13219 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC30.56■■■□□ 2.48
PAPPAQ13219 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC30.56■■■□□ 2.48
PAPPAQ13219 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
PAPPAQ13219 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC30.56■■■□□ 2.48
PAPPAQ13219 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
PAPPAQ13219 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
PAPPAQ13219 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC30.55■■■□□ 2.48
PAPPAQ13219 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
PAPPAQ13219 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
PAPPAQ13219 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC30.55■■■□□ 2.48
PAPPAQ13219 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC30.54■■■□□ 2.48
PAPPAQ13219 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
PAPPAQ13219 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC30.54■■■□□ 2.48
PAPPAQ13219 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC30.54■■■□□ 2.48
PAPPAQ13219 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
PAPPAQ13219 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
PAPPAQ13219 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
PAPPAQ13219 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
PAPPAQ13219 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
PAPPAQ13219 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC30.53■■■□□ 2.48
PAPPAQ13219 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
PAPPAQ13219 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
PAPPAQ13219 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
PAPPAQ13219 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
PAPPAQ13219 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
PAPPAQ13219 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
PAPPAQ13219 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
PAPPAQ13219 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.48
PAPPAQ13219 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC30.51■■■□□ 2.48
PAPPAQ13219 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
PAPPAQ13219 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
PAPPAQ13219 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
PAPPAQ13219 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
PAPPAQ13219 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
PAPPAQ13219 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
PAPPAQ13219 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
PAPPAQ13219 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
PAPPAQ13219 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
PAPPAQ13219 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
PAPPAQ13219 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
PAPPAQ13219 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
PAPPAQ13219 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
PAPPAQ13219 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
PAPPAQ13219 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
PAPPAQ13219 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
PAPPAQ13219 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
PAPPAQ13219 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
PAPPAQ13219 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
PAPPAQ13219 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
PAPPAQ13219 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
PAPPAQ13219 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
PAPPAQ13219 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
PAPPAQ13219 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
PAPPAQ13219 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
PAPPAQ13219 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
PAPPAQ13219 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
PAPPAQ13219 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
PAPPAQ13219 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
PAPPAQ13219 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
PAPPAQ13219 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.47
PAPPAQ13219 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
PAPPAQ13219 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC30.45■■■□□ 2.47
PAPPAQ13219 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC30.45■■■□□ 2.47
PAPPAQ13219 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
PAPPAQ13219 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
PAPPAQ13219 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
PAPPAQ13219 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
PAPPAQ13219 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
PAPPAQ13219 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
PAPPAQ13219 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
PAPPAQ13219 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
PAPPAQ13219 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC30.44■■■□□ 2.46
PAPPAQ13219 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
PAPPAQ13219 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
PAPPAQ13219 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
PAPPAQ13219 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
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