Protein–RNA interactions for Protein: Q13136

PPFIA1, Liprin-alpha-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA1Q13136 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PPFIA1Q13136 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PPFIA1Q13136 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PPFIA1Q13136 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PPFIA1Q13136 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
PPFIA1Q13136 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PPFIA1Q13136 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PPFIA1Q13136 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PPFIA1Q13136 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PPFIA1Q13136 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PPFIA1Q13136 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PPFIA1Q13136 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PPFIA1Q13136 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PPFIA1Q13136 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PPFIA1Q13136 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PPFIA1Q13136 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PPFIA1Q13136 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PPFIA1Q13136 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PPFIA1Q13136 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PPFIA1Q13136 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
PPFIA1Q13136 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
PPFIA1Q13136 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
PPFIA1Q13136 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PPFIA1Q13136 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PPFIA1Q13136 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PPFIA1Q13136 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PPFIA1Q13136 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PPFIA1Q13136 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PPFIA1Q13136 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PPFIA1Q13136 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PPFIA1Q13136 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PPFIA1Q13136 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PPFIA1Q13136 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PPFIA1Q13136 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
PPFIA1Q13136 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PPFIA1Q13136 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PPFIA1Q13136 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PPFIA1Q13136 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PPFIA1Q13136 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PPFIA1Q13136 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PPFIA1Q13136 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PPFIA1Q13136 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PPFIA1Q13136 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PPFIA1Q13136 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PPFIA1Q13136 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PPFIA1Q13136 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
PPFIA1Q13136 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
PPFIA1Q13136 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PPFIA1Q13136 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PPFIA1Q13136 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PPFIA1Q13136 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PPFIA1Q13136 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PPFIA1Q13136 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PPFIA1Q13136 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
PPFIA1Q13136 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PPFIA1Q13136 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PPFIA1Q13136 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PPFIA1Q13136 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PPFIA1Q13136 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PPFIA1Q13136 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PPFIA1Q13136 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PPFIA1Q13136 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PPFIA1Q13136 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PPFIA1Q13136 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PPFIA1Q13136 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PPFIA1Q13136 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PPFIA1Q13136 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
PPFIA1Q13136 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PPFIA1Q13136 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PPFIA1Q13136 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PPFIA1Q13136 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PPFIA1Q13136 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
PPFIA1Q13136 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PPFIA1Q13136 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PPFIA1Q13136 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PPFIA1Q13136 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PPFIA1Q13136 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PPFIA1Q13136 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PPFIA1Q13136 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
PPFIA1Q13136 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PPFIA1Q13136 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PPFIA1Q13136 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PPFIA1Q13136 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PPFIA1Q13136 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PPFIA1Q13136 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PPFIA1Q13136 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PPFIA1Q13136 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PPFIA1Q13136 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PPFIA1Q13136 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PPFIA1Q13136 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PPFIA1Q13136 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PPFIA1Q13136 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PPFIA1Q13136 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PPFIA1Q13136 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PPFIA1Q13136 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PPFIA1Q13136 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PPFIA1Q13136 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PPFIA1Q13136 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PPFIA1Q13136 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PPFIA1Q13136 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
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