Protein–RNA interactions for Protein: Q13042

CDC16, Cell division cycle protein 16 homolog, humanhuman

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Length 620 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC16Q13042 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDC16Q13042 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDC16Q13042 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDC16Q13042 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDC16Q13042 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDC16Q13042 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDC16Q13042 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CDC16Q13042 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDC16Q13042 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDC16Q13042 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CDC16Q13042 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDC16Q13042 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDC16Q13042 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDC16Q13042 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDC16Q13042 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDC16Q13042 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDC16Q13042 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDC16Q13042 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDC16Q13042 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDC16Q13042 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CDC16Q13042 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDC16Q13042 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDC16Q13042 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDC16Q13042 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDC16Q13042 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDC16Q13042 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDC16Q13042 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDC16Q13042 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDC16Q13042 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CDC16Q13042 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CDC16Q13042 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDC16Q13042 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDC16Q13042 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDC16Q13042 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDC16Q13042 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDC16Q13042 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDC16Q13042 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDC16Q13042 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDC16Q13042 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CDC16Q13042 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDC16Q13042 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDC16Q13042 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDC16Q13042 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDC16Q13042 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDC16Q13042 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDC16Q13042 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CDC16Q13042 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CDC16Q13042 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CDC16Q13042 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CDC16Q13042 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CDC16Q13042 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDC16Q13042 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDC16Q13042 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDC16Q13042 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDC16Q13042 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDC16Q13042 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDC16Q13042 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDC16Q13042 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDC16Q13042 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDC16Q13042 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDC16Q13042 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDC16Q13042 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDC16Q13042 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDC16Q13042 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDC16Q13042 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDC16Q13042 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CDC16Q13042 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CDC16Q13042 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDC16Q13042 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDC16Q13042 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDC16Q13042 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDC16Q13042 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDC16Q13042 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDC16Q13042 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDC16Q13042 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDC16Q13042 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDC16Q13042 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDC16Q13042 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDC16Q13042 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDC16Q13042 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CDC16Q13042 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDC16Q13042 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CDC16Q13042 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDC16Q13042 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDC16Q13042 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDC16Q13042 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDC16Q13042 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDC16Q13042 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDC16Q13042 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CDC16Q13042 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDC16Q13042 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDC16Q13042 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDC16Q13042 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDC16Q13042 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDC16Q13042 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDC16Q13042 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDC16Q13042 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDC16Q13042 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDC16Q13042 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDC16Q13042 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
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