Protein–RNA interactions for Protein: Q12846

STX4, Syntaxin-4, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX4Q12846 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
STX4Q12846 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
STX4Q12846 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
STX4Q12846 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
STX4Q12846 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
STX4Q12846 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
STX4Q12846 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
STX4Q12846 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
STX4Q12846 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
STX4Q12846 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
STX4Q12846 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
STX4Q12846 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
STX4Q12846 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
STX4Q12846 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
STX4Q12846 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
STX4Q12846 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
STX4Q12846 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
STX4Q12846 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
STX4Q12846 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
STX4Q12846 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
STX4Q12846 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
STX4Q12846 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
STX4Q12846 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
STX4Q12846 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
STX4Q12846 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22■■□□□ 1.11
STX4Q12846 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22■■□□□ 1.11
STX4Q12846 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
STX4Q12846 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
STX4Q12846 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
STX4Q12846 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
STX4Q12846 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22■■□□□ 1.11
STX4Q12846 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
STX4Q12846 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
STX4Q12846 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
STX4Q12846 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
STX4Q12846 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
STX4Q12846 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
STX4Q12846 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
STX4Q12846 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
STX4Q12846 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
STX4Q12846 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
STX4Q12846 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
STX4Q12846 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
STX4Q12846 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
STX4Q12846 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
STX4Q12846 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
STX4Q12846 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
STX4Q12846 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
STX4Q12846 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
STX4Q12846 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
STX4Q12846 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
STX4Q12846 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
STX4Q12846 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
STX4Q12846 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
STX4Q12846 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
STX4Q12846 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
STX4Q12846 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
STX4Q12846 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
STX4Q12846 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
STX4Q12846 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
STX4Q12846 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
STX4Q12846 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
STX4Q12846 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
STX4Q12846 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
STX4Q12846 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
STX4Q12846 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
STX4Q12846 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
STX4Q12846 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
STX4Q12846 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
STX4Q12846 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
STX4Q12846 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
STX4Q12846 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
STX4Q12846 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
STX4Q12846 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
STX4Q12846 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
STX4Q12846 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
STX4Q12846 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
STX4Q12846 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
STX4Q12846 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
STX4Q12846 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
STX4Q12846 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
STX4Q12846 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
STX4Q12846 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
STX4Q12846 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
STX4Q12846 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
STX4Q12846 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
STX4Q12846 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
STX4Q12846 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
STX4Q12846 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
STX4Q12846 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
STX4Q12846 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
STX4Q12846 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
STX4Q12846 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
STX4Q12846 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
STX4Q12846 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
STX4Q12846 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
STX4Q12846 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
STX4Q12846 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
STX4Q12846 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
STX4Q12846 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
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