Protein–RNA interactions for Protein: Q12748

CTF3, Inner kinetochore subunit CTF3, yeastyeast

Predictions only

Length 733 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CTF3Q12748 RBA50YDR527W 1320 nt5.68□□□□□ -1.5
CTF3Q12748 RMD9YGL107C 1941 nt5.68□□□□□ -1.5
CTF3Q12748 ESC8YOL017W 2145 nt5.68□□□□□ -1.5
CTF3Q12748 PRP40YKL012W 1752 nt5.67□□□□□ -1.5
CTF3Q12748 HOS1YPR068C 1413 nt5.67□□□□□ -1.5
CTF3Q12748 DED81YHR019C 1665 nt5.67□□□□□ -1.5
CTF3Q12748 ARP1YHR129C 1155 nt5.67□□□□□ -1.5
CTF3Q12748 NDC1YML031W 1968 nt5.67□□□□□ -1.5
CTF3Q12748 HSF1YGL073W 2502 nt5.67□□□□□ -1.5
CTF3Q12748 CLB1YGR108W 1416 nt5.66□□□□□ -1.5
CTF3Q12748 ALT2YDR111C 1524 nt5.66□□□□□ -1.5
CTF3Q12748 EAF5YEL018W 840 nt5.66□□□□□ -1.5
CTF3Q12748 POM33YLL023C 840 nt5.66□□□□□ -1.5
CTF3Q12748 YLR317WYLR317W 435 nt5.66□□□□□ -1.5
CTF3Q12748 YMR135W-AYMR135W-A 534 nt5.66□□□□□ -1.5
CTF3Q12748 BAP2YBR068C 1830 nt5.66□□□□□ -1.5
CTF3Q12748 CDS1YBR029C 1374 nt5.66□□□□□ -1.5
CTF3Q12748 BSC5YNR069C 1470 nt5.65□□□□□ -1.5
CTF3Q12748 PTR2YKR093W 1806 nt5.65□□□□□ -1.5
CTF3Q12748 ENT2YLR206W 1842 nt5.65□□□□□ -1.5
CTF3Q12748 YNL228WYNL228W 777 nt5.65□□□□□ -1.5
CTF3Q12748 ETR1YBR026C 1143 nt5.65□□□□□ -1.5
CTF3Q12748 ELC1YPL046C 300 nt5.65□□□□□ -1.5
CTF3Q12748 DPH2YKL191W 1605 nt5.65□□□□□ -1.51
CTF3Q12748 MRC1YCL061C 3291 nt5.65□□□□□ -1.51
CTF3Q12748 QRI1YDL103C 1434 nt5.65□□□□□ -1.51
CTF3Q12748 GPT2YKR067W 2232 nt5.64□□□□□ -1.51
CTF3Q12748 PPR1YLR014C 2715 nt5.64□□□□□ -1.51
CTF3Q12748 ICE2YIL090W 1476 nt5.64□□□□□ -1.51
CTF3Q12748 YFL042CYFL042C 2025 nt5.64□□□□□ -1.51
CTF3Q12748 TKL1YPR074C 2043 nt5.64□□□□□ -1.51
CTF3Q12748 YGR127WYGR127W 939 nt5.63□□□□□ -1.51
CTF3Q12748 YJL068CYJL068C 900 nt5.63□□□□□ -1.51
CTF3Q12748 ATP14YLR295C 375 nt5.63□□□□□ -1.51
CTF3Q12748 BBP1YPL255W 1158 nt5.63□□□□□ -1.51
CTF3Q12748 PIF1YML061C 2580 nt5.63□□□□□ -1.51
CTF3Q12748 MTC1YJL123C 1437 nt5.63□□□□□ -1.51
CTF3Q12748 MTQ2YDR140W 666 nt5.62□□□□□ -1.51
CTF3Q12748 YDR541CYDR541C 1035 nt5.62□□□□□ -1.51
CTF3Q12748 RER2YBR002C 861 nt5.62□□□□□ -1.51
CTF3Q12748 YLH47YPR125W 1365 nt5.62□□□□□ -1.51
CTF3Q12748 FOB1YDR110W 1701 nt5.62□□□□□ -1.51
CTF3Q12748 URA7YBL039C 1740 nt5.62□□□□□ -1.51
CTF3Q12748 VHT1YGR065C 1782 nt5.62□□□□□ -1.51
CTF3Q12748 SUB2YDL084W 1341 nt5.61□□□□□ -1.51
CTF3Q12748 CHO1YER026C 831 nt5.61□□□□□ -1.51
CTF3Q12748 KRE9YJL174W 831 nt5.61□□□□□ -1.51
CTF3Q12748 CBF1YJR060W 1056 nt5.61□□□□□ -1.51
CTF3Q12748 SSK1YLR006C 2139 nt5.61□□□□□ -1.51
CTF3Q12748 HAS1YMR290C 1518 nt5.61□□□□□ -1.51
CTF3Q12748 PFA3YNL326C 1011 nt5.61□□□□□ -1.51
CTF3Q12748 THI21YPL258C 1656 nt5.61□□□□□ -1.51
CTF3Q12748 LDB19YOR322C 2457 nt5.6□□□□□ -1.51
CTF3Q12748 UTP18YJL069C 1785 nt5.6□□□□□ -1.51
CTF3Q12748 MTC5YDR128W 3447 nt5.6□□□□□ -1.51
CTF3Q12748 MET7YOR241W 1647 nt5.6□□□□□ -1.51
CTF3Q12748 YDR396WYDR396W 501 nt5.6□□□□□ -1.51
CTF3Q12748 SUA5YGL169W 1281 nt5.6□□□□□ -1.51
CTF3Q12748 MPM1YJL066C 759 nt5.6□□□□□ -1.51
CTF3Q12748 APN1YKL114C 1104 nt5.6□□□□□ -1.51
CTF3Q12748 NPT1YOR209C 1290 nt5.6□□□□□ -1.51
CTF3Q12748 GEX1YCL073C 1848 nt5.6□□□□□ -1.51
CTF3Q12748 NSI1YDR026C 1713 nt5.6□□□□□ -1.51
CTF3Q12748 NUP1YOR098C 3231 nt5.59□□□□□ -1.51
CTF3Q12748 SSK22YCR073C 3996 nt5.59□□□□□ -1.51
CTF3Q12748 tR(ACG)JtR(ACG)J 73 nt5.59□□□□□ -1.51
CTF3Q12748 ROX3YBL093C 663 nt5.59□□□□□ -1.51
CTF3Q12748 MED4YOR174W 855 nt5.59□□□□□ -1.51
CTF3Q12748 KEX2YNL238W 2445 nt5.58□□□□□ -1.52
CTF3Q12748 SFC1YJR095W 969 nt5.58□□□□□ -1.52
CTF3Q12748 MTQ1YNL063W 945 nt5.58□□□□□ -1.52
CTF3Q12748 GUP2YPL189W 1830 nt5.58□□□□□ -1.52
CTF3Q12748 CCZ1YBR131W 2115 nt5.57□□□□□ -1.52
CTF3Q12748 YAL056C-AYAL056C-A 351 nt5.57□□□□□ -1.52
CTF3Q12748 TAF11YML015C 1041 nt5.57□□□□□ -1.52
CTF3Q12748 SCP1YOR367W 603 nt5.57□□□□□ -1.52
CTF3Q12748 YAP1YML007W 1953 nt5.56□□□□□ -1.52
CTF3Q12748 ULA1YPL003W 1389 nt5.56□□□□□ -1.52
CTF3Q12748 NOP2YNL061W 1857 nt5.56□□□□□ -1.52
CTF3Q12748 RRP45YDR280W 918 nt5.56□□□□□ -1.52
CTF3Q12748 THI4YGR144W 981 nt5.56□□□□□ -1.52
CTF3Q12748 PRP45YAL032C 1140 nt5.56□□□□□ -1.52
CTF3Q12748 SER1YOR184W 1188 nt5.56□□□□□ -1.52
CTF3Q12748 YEF1YEL041W 1488 nt5.56□□□□□ -1.52
CTF3Q12748 HXK2YGL253W 1461 nt5.56□□□□□ -1.52
CTF3Q12748 CLB2YPR119W 1476 nt5.56□□□□□ -1.52
CTF3Q12748 HRP1YOL123W 1605 nt5.56□□□□□ -1.52
CTF3Q12748 UPS3YDR185C 540 nt5.55□□□□□ -1.52
CTF3Q12748 YNL019CYNL019C 855 nt5.55□□□□□ -1.52
CTF3Q12748 YNL033WYNL033W 855 nt5.55□□□□□ -1.52
CTF3Q12748 PSH1YOL054W 1221 nt5.55□□□□□ -1.52
CTF3Q12748 YDR134CYDR134C 411 nt5.54□□□□□ -1.52
CTF3Q12748 IPK1YDR315C 846 nt5.54□□□□□ -1.52
CTF3Q12748 YIL060WYIL060W 435 nt5.54□□□□□ -1.52
CTF3Q12748 CWC27YPL064C 906 nt5.54□□□□□ -1.52
CTF3Q12748 SNT2YGL131C 4212 nt5.54□□□□□ -1.52
CTF3Q12748 AAP1YHR047C 2571 nt5.54□□□□□ -1.52
CTF3Q12748 SPC97YHR172W 2472 nt5.53□□□□□ -1.52
CTF3Q12748 YFL034WYFL034W 3222 nt5.53□□□□□ -1.52
CTF3Q12748 SIP2YGL208W 1248 nt5.53□□□□□ -1.52
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