Protein–RNA interactions for Protein: Q0VDD7

C19orf57, Uncharacterized protein C19orf57, humanhuman

Predictions only

Length 668 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C19orf57Q0VDD7 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C19orf57Q0VDD7 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
C19orf57Q0VDD7 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
C19orf57Q0VDD7 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
C19orf57Q0VDD7 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C19orf57Q0VDD7 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
C19orf57Q0VDD7 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
C19orf57Q0VDD7 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C19orf57Q0VDD7 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C19orf57Q0VDD7 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
C19orf57Q0VDD7 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
C19orf57Q0VDD7 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
C19orf57Q0VDD7 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
C19orf57Q0VDD7 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
C19orf57Q0VDD7 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
C19orf57Q0VDD7 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
C19orf57Q0VDD7 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
C19orf57Q0VDD7 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C19orf57Q0VDD7 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C19orf57Q0VDD7 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
C19orf57Q0VDD7 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
C19orf57Q0VDD7 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
C19orf57Q0VDD7 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
C19orf57Q0VDD7 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C19orf57Q0VDD7 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C19orf57Q0VDD7 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
C19orf57Q0VDD7 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
C19orf57Q0VDD7 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C19orf57Q0VDD7 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
C19orf57Q0VDD7 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
C19orf57Q0VDD7 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
C19orf57Q0VDD7 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
C19orf57Q0VDD7 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C19orf57Q0VDD7 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
C19orf57Q0VDD7 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C19orf57Q0VDD7 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
C19orf57Q0VDD7 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
C19orf57Q0VDD7 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C19orf57Q0VDD7 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
C19orf57Q0VDD7 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
C19orf57Q0VDD7 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
C19orf57Q0VDD7 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
C19orf57Q0VDD7 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C19orf57Q0VDD7 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C19orf57Q0VDD7 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
C19orf57Q0VDD7 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
C19orf57Q0VDD7 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
C19orf57Q0VDD7 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
C19orf57Q0VDD7 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
C19orf57Q0VDD7 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
C19orf57Q0VDD7 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C19orf57Q0VDD7 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
C19orf57Q0VDD7 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C19orf57Q0VDD7 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C19orf57Q0VDD7 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C19orf57Q0VDD7 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
C19orf57Q0VDD7 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
C19orf57Q0VDD7 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
C19orf57Q0VDD7 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
C19orf57Q0VDD7 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
C19orf57Q0VDD7 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
C19orf57Q0VDD7 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
C19orf57Q0VDD7 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
C19orf57Q0VDD7 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
C19orf57Q0VDD7 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
C19orf57Q0VDD7 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
C19orf57Q0VDD7 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
C19orf57Q0VDD7 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
C19orf57Q0VDD7 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
C19orf57Q0VDD7 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
C19orf57Q0VDD7 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
C19orf57Q0VDD7 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
C19orf57Q0VDD7 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C19orf57Q0VDD7 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
C19orf57Q0VDD7 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
C19orf57Q0VDD7 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
C19orf57Q0VDD7 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C19orf57Q0VDD7 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C19orf57Q0VDD7 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C19orf57Q0VDD7 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C19orf57Q0VDD7 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
C19orf57Q0VDD7 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
C19orf57Q0VDD7 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C19orf57Q0VDD7 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
C19orf57Q0VDD7 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C19orf57Q0VDD7 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
C19orf57Q0VDD7 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C19orf57Q0VDD7 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
C19orf57Q0VDD7 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
C19orf57Q0VDD7 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
C19orf57Q0VDD7 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
C19orf57Q0VDD7 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
C19orf57Q0VDD7 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
C19orf57Q0VDD7 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
C19orf57Q0VDD7 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
C19orf57Q0VDD7 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
C19orf57Q0VDD7 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
C19orf57Q0VDD7 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
C19orf57Q0VDD7 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
C19orf57Q0VDD7 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms