Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAK6

LMOD3, Leiomodin-3, humanhuman

Predictions only

Length 560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMOD3Q0VAK6 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
LMOD3Q0VAK6 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
LMOD3Q0VAK6 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
LMOD3Q0VAK6 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
LMOD3Q0VAK6 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
LMOD3Q0VAK6 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC30.57■■■□□ 2.48
LMOD3Q0VAK6 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
LMOD3Q0VAK6 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
LMOD3Q0VAK6 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC30.56■■■□□ 2.48
LMOD3Q0VAK6 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
LMOD3Q0VAK6 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
LMOD3Q0VAK6 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
LMOD3Q0VAK6 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
LMOD3Q0VAK6 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
LMOD3Q0VAK6 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
LMOD3Q0VAK6 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.55■■■□□ 2.48
LMOD3Q0VAK6 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC30.55■■■□□ 2.48
LMOD3Q0VAK6 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
LMOD3Q0VAK6 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
LMOD3Q0VAK6 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
LMOD3Q0VAK6 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
LMOD3Q0VAK6 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
LMOD3Q0VAK6 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.54■■■□□ 2.48
LMOD3Q0VAK6 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
LMOD3Q0VAK6 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
LMOD3Q0VAK6 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
LMOD3Q0VAK6 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
LMOD3Q0VAK6 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
LMOD3Q0VAK6 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
LMOD3Q0VAK6 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
LMOD3Q0VAK6 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
LMOD3Q0VAK6 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
LMOD3Q0VAK6 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
LMOD3Q0VAK6 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
LMOD3Q0VAK6 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
LMOD3Q0VAK6 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
LMOD3Q0VAK6 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC30.51■■■□□ 2.48
LMOD3Q0VAK6 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
LMOD3Q0VAK6 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
LMOD3Q0VAK6 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
LMOD3Q0VAK6 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
LMOD3Q0VAK6 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
LMOD3Q0VAK6 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
LMOD3Q0VAK6 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
LMOD3Q0VAK6 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
LMOD3Q0VAK6 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
LMOD3Q0VAK6 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
LMOD3Q0VAK6 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
LMOD3Q0VAK6 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
LMOD3Q0VAK6 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
LMOD3Q0VAK6 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
LMOD3Q0VAK6 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
LMOD3Q0VAK6 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
LMOD3Q0VAK6 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
LMOD3Q0VAK6 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC30.49■■■□□ 2.47
LMOD3Q0VAK6 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
LMOD3Q0VAK6 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
LMOD3Q0VAK6 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
LMOD3Q0VAK6 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
LMOD3Q0VAK6 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
LMOD3Q0VAK6 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
LMOD3Q0VAK6 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC30.48■■■□□ 2.47
LMOD3Q0VAK6 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC30.48■■■□□ 2.47
LMOD3Q0VAK6 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
LMOD3Q0VAK6 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
LMOD3Q0VAK6 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
LMOD3Q0VAK6 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
LMOD3Q0VAK6 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
LMOD3Q0VAK6 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
LMOD3Q0VAK6 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
LMOD3Q0VAK6 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
LMOD3Q0VAK6 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
LMOD3Q0VAK6 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC30.47■■■□□ 2.47
LMOD3Q0VAK6 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
LMOD3Q0VAK6 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
LMOD3Q0VAK6 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
LMOD3Q0VAK6 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
LMOD3Q0VAK6 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
LMOD3Q0VAK6 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
LMOD3Q0VAK6 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
LMOD3Q0VAK6 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
LMOD3Q0VAK6 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.47
LMOD3Q0VAK6 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.47
LMOD3Q0VAK6 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.46
LMOD3Q0VAK6 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
LMOD3Q0VAK6 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
LMOD3Q0VAK6 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
LMOD3Q0VAK6 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
LMOD3Q0VAK6 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC30.44■■■□□ 2.46
LMOD3Q0VAK6 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
LMOD3Q0VAK6 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC30.44■■■□□ 2.46
LMOD3Q0VAK6 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC30.44■■■□□ 2.46
LMOD3Q0VAK6 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC30.44■■■□□ 2.46
LMOD3Q0VAK6 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
LMOD3Q0VAK6 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
LMOD3Q0VAK6 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
LMOD3Q0VAK6 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
LMOD3Q0VAK6 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
LMOD3Q0VAK6 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
LMOD3Q0VAK6 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms