Protein–RNA interactions for Protein: Q0P140

HSD52, Putative uncharacterized protein HSD52, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSD52Q0P140 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HSD52Q0P140 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HSD52Q0P140 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HSD52Q0P140 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HSD52Q0P140 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HSD52Q0P140 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HSD52Q0P140 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HSD52Q0P140 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HSD52Q0P140 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HSD52Q0P140 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HSD52Q0P140 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HSD52Q0P140 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HSD52Q0P140 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HSD52Q0P140 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HSD52Q0P140 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HSD52Q0P140 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HSD52Q0P140 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HSD52Q0P140 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HSD52Q0P140 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HSD52Q0P140 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HSD52Q0P140 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HSD52Q0P140 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
HSD52Q0P140 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.21
HSD52Q0P140 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
HSD52Q0P140 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
HSD52Q0P140 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HSD52Q0P140 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HSD52Q0P140 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HSD52Q0P140 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
HSD52Q0P140 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HSD52Q0P140 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HSD52Q0P140 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HSD52Q0P140 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HSD52Q0P140 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HSD52Q0P140 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HSD52Q0P140 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HSD52Q0P140 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HSD52Q0P140 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HSD52Q0P140 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HSD52Q0P140 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HSD52Q0P140 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HSD52Q0P140 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HSD52Q0P140 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HSD52Q0P140 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HSD52Q0P140 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HSD52Q0P140 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HSD52Q0P140 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HSD52Q0P140 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HSD52Q0P140 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HSD52Q0P140 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HSD52Q0P140 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HSD52Q0P140 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HSD52Q0P140 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HSD52Q0P140 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HSD52Q0P140 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HSD52Q0P140 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HSD52Q0P140 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HSD52Q0P140 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HSD52Q0P140 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HSD52Q0P140 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HSD52Q0P140 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HSD52Q0P140 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
HSD52Q0P140 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HSD52Q0P140 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HSD52Q0P140 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HSD52Q0P140 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HSD52Q0P140 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HSD52Q0P140 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HSD52Q0P140 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HSD52Q0P140 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HSD52Q0P140 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HSD52Q0P140 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HSD52Q0P140 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HSD52Q0P140 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HSD52Q0P140 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
HSD52Q0P140 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HSD52Q0P140 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HSD52Q0P140 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HSD52Q0P140 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HSD52Q0P140 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HSD52Q0P140 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HSD52Q0P140 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HSD52Q0P140 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HSD52Q0P140 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HSD52Q0P140 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HSD52Q0P140 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HSD52Q0P140 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HSD52Q0P140 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HSD52Q0P140 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HSD52Q0P140 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HSD52Q0P140 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HSD52Q0P140 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HSD52Q0P140 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HSD52Q0P140 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
HSD52Q0P140 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
HSD52Q0P140 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HSD52Q0P140 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HSD52Q0P140 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HSD52Q0P140 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HSD52Q0P140 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms