Protein–RNA interactions for Protein: Q08E93

FAM27E3, Protein FAM27E3, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM27E3Q08E93 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
FAM27E3Q08E93 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
FAM27E3Q08E93 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FAM27E3Q08E93 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FAM27E3Q08E93 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FAM27E3Q08E93 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FAM27E3Q08E93 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FAM27E3Q08E93 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FAM27E3Q08E93 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FAM27E3Q08E93 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FAM27E3Q08E93 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FAM27E3Q08E93 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
FAM27E3Q08E93 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FAM27E3Q08E93 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FAM27E3Q08E93 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FAM27E3Q08E93 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FAM27E3Q08E93 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FAM27E3Q08E93 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
FAM27E3Q08E93 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FAM27E3Q08E93 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FAM27E3Q08E93 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FAM27E3Q08E93 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FAM27E3Q08E93 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FAM27E3Q08E93 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FAM27E3Q08E93 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
FAM27E3Q08E93 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FAM27E3Q08E93 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FAM27E3Q08E93 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FAM27E3Q08E93 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FAM27E3Q08E93 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FAM27E3Q08E93 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FAM27E3Q08E93 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
FAM27E3Q08E93 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
FAM27E3Q08E93 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
FAM27E3Q08E93 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FAM27E3Q08E93 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FAM27E3Q08E93 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FAM27E3Q08E93 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FAM27E3Q08E93 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
FAM27E3Q08E93 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
FAM27E3Q08E93 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
FAM27E3Q08E93 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
FAM27E3Q08E93 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
FAM27E3Q08E93 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FAM27E3Q08E93 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
FAM27E3Q08E93 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
FAM27E3Q08E93 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
FAM27E3Q08E93 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FAM27E3Q08E93 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FAM27E3Q08E93 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
FAM27E3Q08E93 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
FAM27E3Q08E93 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
FAM27E3Q08E93 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FAM27E3Q08E93 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
FAM27E3Q08E93 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
FAM27E3Q08E93 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FAM27E3Q08E93 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
FAM27E3Q08E93 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FAM27E3Q08E93 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
FAM27E3Q08E93 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
FAM27E3Q08E93 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FAM27E3Q08E93 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FAM27E3Q08E93 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FAM27E3Q08E93 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
FAM27E3Q08E93 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
FAM27E3Q08E93 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
FAM27E3Q08E93 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
FAM27E3Q08E93 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
FAM27E3Q08E93 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FAM27E3Q08E93 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
FAM27E3Q08E93 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FAM27E3Q08E93 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
FAM27E3Q08E93 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
FAM27E3Q08E93 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
FAM27E3Q08E93 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
FAM27E3Q08E93 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
FAM27E3Q08E93 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
FAM27E3Q08E93 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
FAM27E3Q08E93 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
FAM27E3Q08E93 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
FAM27E3Q08E93 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
FAM27E3Q08E93 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
FAM27E3Q08E93 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
FAM27E3Q08E93 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
FAM27E3Q08E93 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
FAM27E3Q08E93 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
FAM27E3Q08E93 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
FAM27E3Q08E93 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
FAM27E3Q08E93 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
FAM27E3Q08E93 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
FAM27E3Q08E93 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
FAM27E3Q08E93 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FAM27E3Q08E93 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FAM27E3Q08E93 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FAM27E3Q08E93 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
FAM27E3Q08E93 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FAM27E3Q08E93 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
FAM27E3Q08E93 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FAM27E3Q08E93 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
FAM27E3Q08E93 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms