Protein–RNA interactions for Protein: Q08623

PUDP, Pseudouridine-5'-phosphatase, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUDPQ08623 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PUDPQ08623 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PUDPQ08623 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PUDPQ08623 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PUDPQ08623 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PUDPQ08623 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
PUDPQ08623 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PUDPQ08623 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PUDPQ08623 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PUDPQ08623 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PUDPQ08623 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PUDPQ08623 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PUDPQ08623 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PUDPQ08623 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PUDPQ08623 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PUDPQ08623 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PUDPQ08623 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PUDPQ08623 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PUDPQ08623 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PUDPQ08623 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PUDPQ08623 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PUDPQ08623 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PUDPQ08623 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
PUDPQ08623 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PUDPQ08623 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PUDPQ08623 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PUDPQ08623 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PUDPQ08623 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PUDPQ08623 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PUDPQ08623 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PUDPQ08623 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PUDPQ08623 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PUDPQ08623 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PUDPQ08623 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PUDPQ08623 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PUDPQ08623 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PUDPQ08623 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PUDPQ08623 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PUDPQ08623 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PUDPQ08623 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PUDPQ08623 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PUDPQ08623 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PUDPQ08623 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PUDPQ08623 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PUDPQ08623 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PUDPQ08623 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PUDPQ08623 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PUDPQ08623 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PUDPQ08623 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PUDPQ08623 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
PUDPQ08623 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PUDPQ08623 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PUDPQ08623 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PUDPQ08623 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PUDPQ08623 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PUDPQ08623 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PUDPQ08623 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PUDPQ08623 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
PUDPQ08623 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PUDPQ08623 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PUDPQ08623 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PUDPQ08623 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PUDPQ08623 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PUDPQ08623 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PUDPQ08623 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PUDPQ08623 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PUDPQ08623 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PUDPQ08623 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PUDPQ08623 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PUDPQ08623 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PUDPQ08623 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PUDPQ08623 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PUDPQ08623 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PUDPQ08623 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PUDPQ08623 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PUDPQ08623 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PUDPQ08623 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PUDPQ08623 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PUDPQ08623 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PUDPQ08623 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PUDPQ08623 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PUDPQ08623 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PUDPQ08623 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PUDPQ08623 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PUDPQ08623 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PUDPQ08623 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PUDPQ08623 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PUDPQ08623 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PUDPQ08623 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PUDPQ08623 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PUDPQ08623 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PUDPQ08623 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PUDPQ08623 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PUDPQ08623 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PUDPQ08623 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PUDPQ08623 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PUDPQ08623 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PUDPQ08623 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
PUDPQ08623 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PUDPQ08623 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms