Protein–RNA interactions for Protein: Q08499

PDE4D, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4D, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4DQ08499 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PDE4DQ08499 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PDE4DQ08499 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PDE4DQ08499 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PDE4DQ08499 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PDE4DQ08499 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PDE4DQ08499 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PDE4DQ08499 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PDE4DQ08499 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PDE4DQ08499 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PDE4DQ08499 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PDE4DQ08499 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PDE4DQ08499 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
PDE4DQ08499 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PDE4DQ08499 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PDE4DQ08499 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
PDE4DQ08499 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PDE4DQ08499 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PDE4DQ08499 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PDE4DQ08499 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PDE4DQ08499 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PDE4DQ08499 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
PDE4DQ08499 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PDE4DQ08499 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PDE4DQ08499 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PDE4DQ08499 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PDE4DQ08499 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PDE4DQ08499 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PDE4DQ08499 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PDE4DQ08499 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PDE4DQ08499 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PDE4DQ08499 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PDE4DQ08499 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PDE4DQ08499 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PDE4DQ08499 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PDE4DQ08499 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PDE4DQ08499 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PDE4DQ08499 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PDE4DQ08499 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PDE4DQ08499 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PDE4DQ08499 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PDE4DQ08499 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PDE4DQ08499 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PDE4DQ08499 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
PDE4DQ08499 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
PDE4DQ08499 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PDE4DQ08499 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PDE4DQ08499 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PDE4DQ08499 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PDE4DQ08499 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PDE4DQ08499 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PDE4DQ08499 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PDE4DQ08499 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PDE4DQ08499 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PDE4DQ08499 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PDE4DQ08499 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PDE4DQ08499 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PDE4DQ08499 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PDE4DQ08499 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PDE4DQ08499 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PDE4DQ08499 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
PDE4DQ08499 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PDE4DQ08499 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
PDE4DQ08499 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PDE4DQ08499 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PDE4DQ08499 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
PDE4DQ08499 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PDE4DQ08499 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PDE4DQ08499 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PDE4DQ08499 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PDE4DQ08499 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PDE4DQ08499 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
PDE4DQ08499 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PDE4DQ08499 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PDE4DQ08499 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PDE4DQ08499 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PDE4DQ08499 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PDE4DQ08499 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PDE4DQ08499 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
PDE4DQ08499 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PDE4DQ08499 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PDE4DQ08499 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PDE4DQ08499 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PDE4DQ08499 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PDE4DQ08499 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PDE4DQ08499 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PDE4DQ08499 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PDE4DQ08499 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PDE4DQ08499 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PDE4DQ08499 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PDE4DQ08499 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PDE4DQ08499 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PDE4DQ08499 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PDE4DQ08499 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
PDE4DQ08499 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PDE4DQ08499 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PDE4DQ08499 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PDE4DQ08499 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PDE4DQ08499 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PDE4DQ08499 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.3 ms