Protein–RNA interactions for Protein: Q08170

SRSF4, Serine/arginine-rich splicing factor 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF4Q08170 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SRSF4Q08170 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SRSF4Q08170 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SRSF4Q08170 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SRSF4Q08170 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SRSF4Q08170 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SRSF4Q08170 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SRSF4Q08170 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SRSF4Q08170 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
SRSF4Q08170 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SRSF4Q08170 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SRSF4Q08170 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SRSF4Q08170 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SRSF4Q08170 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SRSF4Q08170 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SRSF4Q08170 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SRSF4Q08170 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SRSF4Q08170 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SRSF4Q08170 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
SRSF4Q08170 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SRSF4Q08170 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SRSF4Q08170 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SRSF4Q08170 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SRSF4Q08170 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SRSF4Q08170 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SRSF4Q08170 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SRSF4Q08170 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SRSF4Q08170 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SRSF4Q08170 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SRSF4Q08170 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SRSF4Q08170 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SRSF4Q08170 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SRSF4Q08170 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
SRSF4Q08170 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
SRSF4Q08170 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SRSF4Q08170 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SRSF4Q08170 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SRSF4Q08170 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
SRSF4Q08170 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SRSF4Q08170 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SRSF4Q08170 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SRSF4Q08170 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SRSF4Q08170 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SRSF4Q08170 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SRSF4Q08170 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SRSF4Q08170 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SRSF4Q08170 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SRSF4Q08170 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SRSF4Q08170 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SRSF4Q08170 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SRSF4Q08170 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SRSF4Q08170 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SRSF4Q08170 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SRSF4Q08170 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SRSF4Q08170 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SRSF4Q08170 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SRSF4Q08170 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SRSF4Q08170 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SRSF4Q08170 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SRSF4Q08170 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SRSF4Q08170 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SRSF4Q08170 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SRSF4Q08170 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SRSF4Q08170 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SRSF4Q08170 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SRSF4Q08170 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SRSF4Q08170 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SRSF4Q08170 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SRSF4Q08170 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
SRSF4Q08170 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
SRSF4Q08170 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SRSF4Q08170 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SRSF4Q08170 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SRSF4Q08170 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SRSF4Q08170 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SRSF4Q08170 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SRSF4Q08170 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SRSF4Q08170 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SRSF4Q08170 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SRSF4Q08170 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SRSF4Q08170 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SRSF4Q08170 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SRSF4Q08170 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SRSF4Q08170 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SRSF4Q08170 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SRSF4Q08170 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SRSF4Q08170 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SRSF4Q08170 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SRSF4Q08170 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SRSF4Q08170 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SRSF4Q08170 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SRSF4Q08170 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SRSF4Q08170 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SRSF4Q08170 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SRSF4Q08170 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SRSF4Q08170 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SRSF4Q08170 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SRSF4Q08170 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
SRSF4Q08170 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
SRSF4Q08170 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.5 ms