Protein–RNA interactions for Protein: Q08109

HRD1, ERAD-associated E3 ubiquitin-protein ligase HRD1, yeastyeast

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HRD1Q08109 PAN6YIL145C 930 nt4.61□□□□□ -1.67
HRD1Q08109 TIF2YJL138C 1188 nt4.61□□□□□ -1.67
HRD1Q08109 YKL107WYKL107W 930 nt4.61□□□□□ -1.67
HRD1Q08109 TIF1YKR059W 1188 nt4.61□□□□□ -1.67
HRD1Q08109 GRS1YBR121C 2004 nt4.6□□□□□ -1.67
HRD1Q08109 MTQ2YDR140W 666 nt4.6□□□□□ -1.67
HRD1Q08109 ZRT1YGL255W 1131 nt4.6□□□□□ -1.67
HRD1Q08109 ECM19YLR390W 339 nt4.6□□□□□ -1.67
HRD1Q08109 RPT2YDL007W 1314 nt4.6□□□□□ -1.67
HRD1Q08109 PDH1YPR002W 1551 nt4.6□□□□□ -1.67
HRD1Q08109 YEL077CYEL077C 3834 nt4.6□□□□□ -1.67
HRD1Q08109 ARO10YDR380W 1908 nt4.6□□□□□ -1.67
HRD1Q08109 FET3YMR058W 1911 nt4.6□□□□□ -1.67
HRD1Q08109 BLM10YFL007W 6432 nt4.6□□□□□ -1.67
HRD1Q08109 RIM15YFL033C 5313 nt4.59□□□□□ -1.67
HRD1Q08109 YDL121CYDL121C 450 nt4.59□□□□□ -1.67
HRD1Q08109 GLO2YDR272W 825 nt4.59□□□□□ -1.67
HRD1Q08109 UGO1YDR470C 1509 nt4.59□□□□□ -1.67
HRD1Q08109 UTP7YER082C 1665 nt4.59□□□□□ -1.67
HRD1Q08109 PRP43YGL120C 2304 nt4.59□□□□□ -1.67
HRD1Q08109 YKR041WYKR041W 753 nt4.59□□□□□ -1.67
HRD1Q08109 PUF3YLL013C 2640 nt4.59□□□□□ -1.67
HRD1Q08109 VMA13YPR036W 1437 nt4.59□□□□□ -1.67
HRD1Q08109 SEG2YKL105C 3399 nt4.59□□□□□ -1.68
HRD1Q08109 MKC7YDR144C 1791 nt4.58□□□□□ -1.68
HRD1Q08109 SSZ1YHR064C 1617 nt4.58□□□□□ -1.68
HRD1Q08109 YLR126CYLR126C 756 nt4.58□□□□□ -1.68
HRD1Q08109 IDP3YNL009W 1263 nt4.58□□□□□ -1.68
HRD1Q08109 GRE1YPL223C 507 nt4.58□□□□□ -1.68
HRD1Q08109 ATH1YPR026W 3636 nt4.58□□□□□ -1.68
HRD1Q08109 PDC1YLR044C 1692 nt4.57□□□□□ -1.68
HRD1Q08109 FOL1YNL256W 2475 nt4.57□□□□□ -1.68
HRD1Q08109 FUM1YPL262W 1467 nt4.57□□□□□ -1.68
HRD1Q08109 ORC5YNL261W 1440 nt4.57□□□□□ -1.68
HRD1Q08109 YCR047W-AYCR047W-A 207 nt4.57□□□□□ -1.68
HRD1Q08109 YDR053WYDR053W 396 nt4.57□□□□□ -1.68
HRD1Q08109 SPO7YAL009W 780 nt4.57□□□□□ -1.68
HRD1Q08109 YML101C-AYML101C-A 318 nt4.57□□□□□ -1.68
HRD1Q08109 PGA3YML125C 939 nt4.57□□□□□ -1.68
HRD1Q08109 YBL044WYBL044W 369 nt4.57□□□□□ -1.68
HRD1Q08109 BUB3YOR026W 1026 nt4.57□□□□□ -1.68
HRD1Q08109 YPR195CYPR195C 330 nt4.57□□□□□ -1.68
HRD1Q08109 NRD1YNL251C 1728 nt4.57□□□□□ -1.68
HRD1Q08109 SHM1YBR263W 1473 nt4.56□□□□□ -1.68
HRD1Q08109 SMF3YLR034C 1422 nt4.56□□□□□ -1.68
HRD1Q08109 LYS21YDL131W 1323 nt4.56□□□□□ -1.68
HRD1Q08109 YDR541CYDR541C 1035 nt4.56□□□□□ -1.68
HRD1Q08109 SCS2YER120W 735 nt4.56□□□□□ -1.68
HRD1Q08109 VMA16YHR026W 642 nt4.56□□□□□ -1.68
HRD1Q08109 YBR126W-AYBR126W-A 207 nt4.56□□□□□ -1.68
HRD1Q08109 PEX32YBR168W 1242 nt4.56□□□□□ -1.68
HRD1Q08109 SFI1YLL003W 2841 nt4.56□□□□□ -1.68
HRD1Q08109 VPS72YDR485C 2388 nt4.56□□□□□ -1.68
HRD1Q08109 VHS2YIL135C 1311 nt4.55□□□□□ -1.68
HRD1Q08109 DNF2YDR093W 4839 nt4.55□□□□□ -1.68
HRD1Q08109 MSC7YHR039C 1935 nt4.55□□□□□ -1.68
HRD1Q08109 LUC7YDL087C 786 nt4.55□□□□□ -1.68
HRD1Q08109 MTQ1YNL063W 945 nt4.55□□□□□ -1.68
HRD1Q08109 PIN2YOR104W 849 nt4.55□□□□□ -1.68
HRD1Q08109 FAA3YIL009W 2085 nt4.55□□□□□ -1.68
HRD1Q08109 GLT1YDL171C 6438 nt4.54□□□□□ -1.68
HRD1Q08109 NQM1YGR043C 1002 nt4.54□□□□□ -1.68
HRD1Q08109 YLR346CYLR346C 306 nt4.54□□□□□ -1.68
HRD1Q08109 HXT3YDR345C 1704 nt4.54□□□□□ -1.68
HRD1Q08109 PCA1YBR295W 3651 nt4.54□□□□□ -1.68
HRD1Q08109 YDR154CYDR154C 351 nt4.53□□□□□ -1.68
HRD1Q08109 UBC4YBR082C 447 nt4.53□□□□□ -1.68
HRD1Q08109 YOR1YGR281W 4434 nt4.52□□□□□ -1.69
HRD1Q08109 GEP3YOR205C 1671 nt4.52□□□□□ -1.69
HRD1Q08109 HFI1YPL254W 1467 nt4.52□□□□□ -1.69
HRD1Q08109 MRPL15YLR312W-A 762 nt4.52□□□□□ -1.69
HRD1Q08109 YNR048WYNR048W 1182 nt4.52□□□□□ -1.69
HRD1Q08109 HRP1YOL123W 1605 nt4.52□□□□□ -1.69
HRD1Q08109 ACF2YLR144C 2340 nt4.52□□□□□ -1.69
HRD1Q08109 NUP116YMR047C 3342 nt4.52□□□□□ -1.69
HRD1Q08109 SHE10YGL228W 1734 nt4.52□□□□□ -1.69
HRD1Q08109 FHL1YPR104C 2811 nt4.51□□□□□ -1.69
HRD1Q08109 UBP9YER098W 2265 nt4.51□□□□□ -1.69
HRD1Q08109 DAL81YIR023W 2913 nt4.51□□□□□ -1.69
HRD1Q08109 BRF1YGR246C 1791 nt4.51□□□□□ -1.69
HRD1Q08109 SYG1YIL047C 2709 nt4.51□□□□□ -1.69
HRD1Q08109 GPM3YOL056W 912 nt4.51□□□□□ -1.69
HRD1Q08109 CPS1YJL172W 1731 nt4.51□□□□□ -1.69
HRD1Q08109 ARN1YHL040C 1884 nt4.51□□□□□ -1.69
HRD1Q08109 DED81YHR019C 1665 nt4.51□□□□□ -1.69
HRD1Q08109 SIF2YBR103W 1608 nt4.5□□□□□ -1.69
HRD1Q08109 YPL277CYPL277C 1464 nt4.5□□□□□ -1.69
HRD1Q08109 RPT4YOR259C 1314 nt4.5□□□□□ -1.69
HRD1Q08109 DBF2YGR092W 1719 nt4.5□□□□□ -1.69
HRD1Q08109 COX26YDR119W-A 201 nt4.5□□□□□ -1.69
HRD1Q08109 MRF1YGL143C 1242 nt4.5□□□□□ -1.69
HRD1Q08109 SPG4YMR107W 348 nt4.5□□□□□ -1.69
HRD1Q08109 SNO4YMR322C 714 nt4.5□□□□□ -1.69
HRD1Q08109 HSP33YOR391C 714 nt4.5□□□□□ -1.69
HRD1Q08109 HSP32YPL280W 714 nt4.5□□□□□ -1.69
HRD1Q08109 CDC4YFL009W 2340 nt4.5□□□□□ -1.69
HRD1Q08109 GIP2YER054C 1647 nt4.5□□□□□ -1.69
HRD1Q08109 APL6YGR261C 2430 nt4.5□□□□□ -1.69
HRD1Q08109 YDL144CYDL144C 1071 nt4.49□□□□□ -1.69
HRD1Q08109 GCS1YDL226C 1059 nt4.49□□□□□ -1.69
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 71.4 ms