Protein–RNA interactions for Protein: Q07011

TNFRSF9, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 9, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF9Q07011 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TNFRSF9Q07011 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TNFRSF9Q07011 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TNFRSF9Q07011 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TNFRSF9Q07011 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TNFRSF9Q07011 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TNFRSF9Q07011 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TNFRSF9Q07011 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TNFRSF9Q07011 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TNFRSF9Q07011 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TNFRSF9Q07011 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TNFRSF9Q07011 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TNFRSF9Q07011 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TNFRSF9Q07011 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TNFRSF9Q07011 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TNFRSF9Q07011 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TNFRSF9Q07011 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TNFRSF9Q07011 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TNFRSF9Q07011 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TNFRSF9Q07011 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
TNFRSF9Q07011 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
TNFRSF9Q07011 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TNFRSF9Q07011 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TNFRSF9Q07011 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TNFRSF9Q07011 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TNFRSF9Q07011 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TNFRSF9Q07011 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
TNFRSF9Q07011 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TNFRSF9Q07011 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TNFRSF9Q07011 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TNFRSF9Q07011 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TNFRSF9Q07011 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TNFRSF9Q07011 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TNFRSF9Q07011 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TNFRSF9Q07011 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TNFRSF9Q07011 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
TNFRSF9Q07011 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
TNFRSF9Q07011 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TNFRSF9Q07011 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TNFRSF9Q07011 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TNFRSF9Q07011 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TNFRSF9Q07011 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TNFRSF9Q07011 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TNFRSF9Q07011 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TNFRSF9Q07011 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TNFRSF9Q07011 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TNFRSF9Q07011 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TNFRSF9Q07011 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TNFRSF9Q07011 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TNFRSF9Q07011 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TNFRSF9Q07011 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TNFRSF9Q07011 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TNFRSF9Q07011 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TNFRSF9Q07011 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TNFRSF9Q07011 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TNFRSF9Q07011 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TNFRSF9Q07011 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TNFRSF9Q07011 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TNFRSF9Q07011 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TNFRSF9Q07011 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
TNFRSF9Q07011 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TNFRSF9Q07011 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TNFRSF9Q07011 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TNFRSF9Q07011 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TNFRSF9Q07011 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TNFRSF9Q07011 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TNFRSF9Q07011 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TNFRSF9Q07011 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TNFRSF9Q07011 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TNFRSF9Q07011 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TNFRSF9Q07011 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TNFRSF9Q07011 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TNFRSF9Q07011 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TNFRSF9Q07011 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TNFRSF9Q07011 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TNFRSF9Q07011 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TNFRSF9Q07011 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TNFRSF9Q07011 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TNFRSF9Q07011 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TNFRSF9Q07011 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TNFRSF9Q07011 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TNFRSF9Q07011 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TNFRSF9Q07011 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TNFRSF9Q07011 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TNFRSF9Q07011 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TNFRSF9Q07011 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TNFRSF9Q07011 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TNFRSF9Q07011 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TNFRSF9Q07011 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TNFRSF9Q07011 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TNFRSF9Q07011 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TNFRSF9Q07011 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
TNFRSF9Q07011 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TNFRSF9Q07011 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TNFRSF9Q07011 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TNFRSF9Q07011 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TNFRSF9Q07011 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TNFRSF9Q07011 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TNFRSF9Q07011 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
TNFRSF9Q07011 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms