Protein–RNA interactions for Protein: Q06481

APLP2, Amyloid-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 763 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APLP2Q06481 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC36.6■■■■□ 3.45
APLP2Q06481 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
APLP2Q06481 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC36.6■■■■□ 3.45
APLP2Q06481 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
APLP2Q06481 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
APLP2Q06481 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
APLP2Q06481 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
APLP2Q06481 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
APLP2Q06481 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC36.59■■■■□ 3.45
APLP2Q06481 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
APLP2Q06481 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC36.59■■■■□ 3.45
APLP2Q06481 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
APLP2Q06481 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC36.58■■■■□ 3.45
APLP2Q06481 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
APLP2Q06481 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
APLP2Q06481 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
APLP2Q06481 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
APLP2Q06481 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.58■■■■□ 3.45
APLP2Q06481 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
APLP2Q06481 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
APLP2Q06481 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC36.58■■■■□ 3.45
APLP2Q06481 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
APLP2Q06481 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
APLP2Q06481 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC36.56■■■■□ 3.44
APLP2Q06481 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC36.56■■■■□ 3.44
APLP2Q06481 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC36.56■■■■□ 3.44
APLP2Q06481 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC36.56■■■■□ 3.44
APLP2Q06481 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
APLP2Q06481 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
APLP2Q06481 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.56■■■■□ 3.44
APLP2Q06481 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
APLP2Q06481 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.56■■■■□ 3.44
APLP2Q06481 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
APLP2Q06481 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
APLP2Q06481 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC36.55■■■■□ 3.44
APLP2Q06481 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
APLP2Q06481 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC36.54■■■■□ 3.44
APLP2Q06481 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
APLP2Q06481 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC36.53■■■■□ 3.44
APLP2Q06481 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
APLP2Q06481 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC36.53■■■■□ 3.44
APLP2Q06481 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
APLP2Q06481 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
APLP2Q06481 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC36.53■■■■□ 3.44
APLP2Q06481 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
APLP2Q06481 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
APLP2Q06481 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC36.52■■■■□ 3.44
APLP2Q06481 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.52■■■■□ 3.44
APLP2Q06481 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.51■■■■□ 3.44
APLP2Q06481 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
APLP2Q06481 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
APLP2Q06481 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.5■■■■□ 3.43
APLP2Q06481 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC36.5■■■■□ 3.43
APLP2Q06481 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC36.5■■■■□ 3.43
APLP2Q06481 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
APLP2Q06481 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC36.5■■■■□ 3.43
APLP2Q06481 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.5■■■■□ 3.43
APLP2Q06481 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
APLP2Q06481 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.49■■■■□ 3.43
APLP2Q06481 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
APLP2Q06481 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC36.49■■■■□ 3.43
APLP2Q06481 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC36.49■■■■□ 3.43
APLP2Q06481 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
APLP2Q06481 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC36.48■■■■□ 3.43
APLP2Q06481 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC36.48■■■■□ 3.43
APLP2Q06481 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC36.48■■■■□ 3.43
APLP2Q06481 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC36.48■■■■□ 3.43
APLP2Q06481 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC36.48■■■■□ 3.43
APLP2Q06481 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
APLP2Q06481 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC36.48■■■■□ 3.43
APLP2Q06481 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC36.48■■■■□ 3.43
APLP2Q06481 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
APLP2Q06481 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
APLP2Q06481 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
APLP2Q06481 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
APLP2Q06481 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
APLP2Q06481 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
APLP2Q06481 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
APLP2Q06481 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
APLP2Q06481 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
APLP2Q06481 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
APLP2Q06481 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
APLP2Q06481 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
APLP2Q06481 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC36.46■■■■□ 3.43
APLP2Q06481 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
APLP2Q06481 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
APLP2Q06481 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
APLP2Q06481 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
APLP2Q06481 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC36.45■■■■□ 3.43
APLP2Q06481 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC36.44■■■■□ 3.42
APLP2Q06481 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC36.44■■■■□ 3.42
APLP2Q06481 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
APLP2Q06481 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC36.44■■■■□ 3.42
APLP2Q06481 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
APLP2Q06481 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
APLP2Q06481 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC36.43■■■■□ 3.42
APLP2Q06481 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.43■■■■□ 3.42
APLP2Q06481 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC36.42■■■■□ 3.42
APLP2Q06481 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC36.42■■■■□ 3.42
APLP2Q06481 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC36.42■■■■□ 3.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms