Protein–RNA interactions for Protein: Q05901

CHRNB3, Neuronal acetylcholine receptor subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB3Q05901 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHRNB3Q05901 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHRNB3Q05901 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHRNB3Q05901 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHRNB3Q05901 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHRNB3Q05901 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHRNB3Q05901 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CHRNB3Q05901 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CHRNB3Q05901 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CHRNB3Q05901 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CHRNB3Q05901 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CHRNB3Q05901 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CHRNB3Q05901 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHRNB3Q05901 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHRNB3Q05901 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHRNB3Q05901 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHRNB3Q05901 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHRNB3Q05901 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHRNB3Q05901 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CHRNB3Q05901 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHRNB3Q05901 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHRNB3Q05901 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHRNB3Q05901 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHRNB3Q05901 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHRNB3Q05901 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHRNB3Q05901 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHRNB3Q05901 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CHRNB3Q05901 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CHRNB3Q05901 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CHRNB3Q05901 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CHRNB3Q05901 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CHRNB3Q05901 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CHRNB3Q05901 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CHRNB3Q05901 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CHRNB3Q05901 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHRNB3Q05901 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHRNB3Q05901 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHRNB3Q05901 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHRNB3Q05901 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHRNB3Q05901 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHRNB3Q05901 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHRNB3Q05901 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHRNB3Q05901 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHRNB3Q05901 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHRNB3Q05901 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHRNB3Q05901 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CHRNB3Q05901 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CHRNB3Q05901 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CHRNB3Q05901 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CHRNB3Q05901 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CHRNB3Q05901 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CHRNB3Q05901 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CHRNB3Q05901 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CHRNB3Q05901 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CHRNB3Q05901 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CHRNB3Q05901 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CHRNB3Q05901 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CHRNB3Q05901 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CHRNB3Q05901 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CHRNB3Q05901 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CHRNB3Q05901 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CHRNB3Q05901 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CHRNB3Q05901 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CHRNB3Q05901 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CHRNB3Q05901 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CHRNB3Q05901 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CHRNB3Q05901 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CHRNB3Q05901 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CHRNB3Q05901 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CHRNB3Q05901 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CHRNB3Q05901 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CHRNB3Q05901 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHRNB3Q05901 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHRNB3Q05901 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHRNB3Q05901 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHRNB3Q05901 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHRNB3Q05901 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHRNB3Q05901 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHRNB3Q05901 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHRNB3Q05901 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHRNB3Q05901 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHRNB3Q05901 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CHRNB3Q05901 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHRNB3Q05901 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHRNB3Q05901 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHRNB3Q05901 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHRNB3Q05901 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHRNB3Q05901 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHRNB3Q05901 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHRNB3Q05901 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHRNB3Q05901 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHRNB3Q05901 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHRNB3Q05901 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHRNB3Q05901 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHRNB3Q05901 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHRNB3Q05901 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHRNB3Q05901 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHRNB3Q05901 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHRNB3Q05901 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CHRNB3Q05901 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms