Protein–RNA interactions for Protein: Q03923

ZNF85, Zinc finger protein 85, humanhuman

Predictions only

Length 595 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF85Q03923 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ZNF85Q03923 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ZNF85Q03923 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ZNF85Q03923 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ZNF85Q03923 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ZNF85Q03923 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ZNF85Q03923 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ZNF85Q03923 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ZNF85Q03923 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ZNF85Q03923 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ZNF85Q03923 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ZNF85Q03923 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ZNF85Q03923 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ZNF85Q03923 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ZNF85Q03923 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ZNF85Q03923 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ZNF85Q03923 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ZNF85Q03923 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ZNF85Q03923 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ZNF85Q03923 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ZNF85Q03923 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ZNF85Q03923 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ZNF85Q03923 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ZNF85Q03923 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ZNF85Q03923 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ZNF85Q03923 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ZNF85Q03923 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ZNF85Q03923 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ZNF85Q03923 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ZNF85Q03923 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ZNF85Q03923 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ZNF85Q03923 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
ZNF85Q03923 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ZNF85Q03923 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
ZNF85Q03923 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
ZNF85Q03923 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
ZNF85Q03923 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ZNF85Q03923 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ZNF85Q03923 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ZNF85Q03923 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ZNF85Q03923 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ZNF85Q03923 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ZNF85Q03923 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ZNF85Q03923 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ZNF85Q03923 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ZNF85Q03923 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ZNF85Q03923 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ZNF85Q03923 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ZNF85Q03923 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ZNF85Q03923 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ZNF85Q03923 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ZNF85Q03923 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ZNF85Q03923 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
ZNF85Q03923 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
ZNF85Q03923 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ZNF85Q03923 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
ZNF85Q03923 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
ZNF85Q03923 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ZNF85Q03923 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ZNF85Q03923 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ZNF85Q03923 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ZNF85Q03923 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
ZNF85Q03923 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ZNF85Q03923 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ZNF85Q03923 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ZNF85Q03923 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ZNF85Q03923 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ZNF85Q03923 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ZNF85Q03923 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
ZNF85Q03923 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ZNF85Q03923 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ZNF85Q03923 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ZNF85Q03923 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ZNF85Q03923 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ZNF85Q03923 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ZNF85Q03923 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ZNF85Q03923 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ZNF85Q03923 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ZNF85Q03923 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZNF85Q03923 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZNF85Q03923 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZNF85Q03923 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZNF85Q03923 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZNF85Q03923 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZNF85Q03923 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZNF85Q03923 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZNF85Q03923 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZNF85Q03923 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZNF85Q03923 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZNF85Q03923 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZNF85Q03923 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZNF85Q03923 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZNF85Q03923 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZNF85Q03923 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZNF85Q03923 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZNF85Q03923 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZNF85Q03923 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZNF85Q03923 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZNF85Q03923 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZNF85Q03923 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms