Protein–RNA interactions for Protein: Q03403

TFF2, Trefoil factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFF2Q03403 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
TFF2Q03403 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TFF2Q03403 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TFF2Q03403 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TFF2Q03403 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TFF2Q03403 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TFF2Q03403 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TFF2Q03403 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
TFF2Q03403 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
TFF2Q03403 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TFF2Q03403 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TFF2Q03403 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TFF2Q03403 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TFF2Q03403 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TFF2Q03403 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TFF2Q03403 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TFF2Q03403 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TFF2Q03403 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TFF2Q03403 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TFF2Q03403 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TFF2Q03403 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
TFF2Q03403 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TFF2Q03403 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
TFF2Q03403 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TFF2Q03403 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TFF2Q03403 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TFF2Q03403 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TFF2Q03403 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TFF2Q03403 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TFF2Q03403 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TFF2Q03403 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
TFF2Q03403 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TFF2Q03403 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TFF2Q03403 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TFF2Q03403 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TFF2Q03403 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TFF2Q03403 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TFF2Q03403 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TFF2Q03403 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TFF2Q03403 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TFF2Q03403 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TFF2Q03403 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
TFF2Q03403 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TFF2Q03403 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TFF2Q03403 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TFF2Q03403 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TFF2Q03403 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TFF2Q03403 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TFF2Q03403 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TFF2Q03403 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TFF2Q03403 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TFF2Q03403 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TFF2Q03403 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TFF2Q03403 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TFF2Q03403 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TFF2Q03403 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TFF2Q03403 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TFF2Q03403 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TFF2Q03403 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TFF2Q03403 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TFF2Q03403 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TFF2Q03403 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
TFF2Q03403 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
TFF2Q03403 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
TFF2Q03403 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
TFF2Q03403 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
TFF2Q03403 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TFF2Q03403 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TFF2Q03403 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TFF2Q03403 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TFF2Q03403 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TFF2Q03403 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
TFF2Q03403 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TFF2Q03403 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TFF2Q03403 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TFF2Q03403 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TFF2Q03403 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TFF2Q03403 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TFF2Q03403 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TFF2Q03403 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TFF2Q03403 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TFF2Q03403 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TFF2Q03403 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TFF2Q03403 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TFF2Q03403 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TFF2Q03403 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TFF2Q03403 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TFF2Q03403 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TFF2Q03403 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TFF2Q03403 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TFF2Q03403 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TFF2Q03403 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TFF2Q03403 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TFF2Q03403 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TFF2Q03403 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TFF2Q03403 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
TFF2Q03403 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
TFF2Q03403 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TFF2Q03403 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TFF2Q03403 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms