Protein–RNA interactions for Protein: Q03393

PTS, 6-pyruvoyl tetrahydrobiopterin synthase, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTSQ03393 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTSQ03393 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTSQ03393 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTSQ03393 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTSQ03393 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTSQ03393 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTSQ03393 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTSQ03393 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTSQ03393 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTSQ03393 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTSQ03393 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PTSQ03393 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PTSQ03393 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTSQ03393 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTSQ03393 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTSQ03393 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTSQ03393 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTSQ03393 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTSQ03393 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTSQ03393 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTSQ03393 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTSQ03393 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTSQ03393 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTSQ03393 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTSQ03393 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTSQ03393 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTSQ03393 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTSQ03393 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTSQ03393 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTSQ03393 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTSQ03393 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTSQ03393 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTSQ03393 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTSQ03393 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTSQ03393 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTSQ03393 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTSQ03393 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTSQ03393 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
PTSQ03393 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTSQ03393 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PTSQ03393 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PTSQ03393 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTSQ03393 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTSQ03393 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTSQ03393 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTSQ03393 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTSQ03393 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTSQ03393 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTSQ03393 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTSQ03393 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTSQ03393 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTSQ03393 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTSQ03393 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
PTSQ03393 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
PTSQ03393 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTSQ03393 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTSQ03393 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTSQ03393 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTSQ03393 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTSQ03393 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTSQ03393 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTSQ03393 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTSQ03393 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTSQ03393 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTSQ03393 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTSQ03393 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTSQ03393 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
PTSQ03393 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTSQ03393 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
PTSQ03393 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTSQ03393 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTSQ03393 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTSQ03393 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
PTSQ03393 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTSQ03393 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTSQ03393 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTSQ03393 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTSQ03393 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTSQ03393 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTSQ03393 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTSQ03393 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTSQ03393 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTSQ03393 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTSQ03393 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTSQ03393 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTSQ03393 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTSQ03393 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTSQ03393 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTSQ03393 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTSQ03393 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTSQ03393 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTSQ03393 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTSQ03393 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
PTSQ03393 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTSQ03393 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTSQ03393 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PTSQ03393 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTSQ03393 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTSQ03393 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTSQ03393 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms