Protein–RNA interactions for Protein: Q02548

PAX5, Paired box protein Pax-5, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX5Q02548 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PAX5Q02548 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PAX5Q02548 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PAX5Q02548 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PAX5Q02548 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
PAX5Q02548 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PAX5Q02548 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PAX5Q02548 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PAX5Q02548 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PAX5Q02548 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PAX5Q02548 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PAX5Q02548 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PAX5Q02548 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PAX5Q02548 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PAX5Q02548 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PAX5Q02548 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PAX5Q02548 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PAX5Q02548 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PAX5Q02548 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PAX5Q02548 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
PAX5Q02548 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PAX5Q02548 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PAX5Q02548 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
PAX5Q02548 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
PAX5Q02548 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PAX5Q02548 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PAX5Q02548 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PAX5Q02548 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PAX5Q02548 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PAX5Q02548 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PAX5Q02548 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PAX5Q02548 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PAX5Q02548 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
PAX5Q02548 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PAX5Q02548 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PAX5Q02548 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PAX5Q02548 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PAX5Q02548 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PAX5Q02548 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PAX5Q02548 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PAX5Q02548 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PAX5Q02548 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PAX5Q02548 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PAX5Q02548 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
PAX5Q02548 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
PAX5Q02548 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PAX5Q02548 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PAX5Q02548 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PAX5Q02548 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PAX5Q02548 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PAX5Q02548 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PAX5Q02548 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PAX5Q02548 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PAX5Q02548 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PAX5Q02548 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
PAX5Q02548 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PAX5Q02548 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PAX5Q02548 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PAX5Q02548 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PAX5Q02548 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PAX5Q02548 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PAX5Q02548 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PAX5Q02548 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PAX5Q02548 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PAX5Q02548 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PAX5Q02548 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PAX5Q02548 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PAX5Q02548 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PAX5Q02548 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PAX5Q02548 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PAX5Q02548 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PAX5Q02548 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PAX5Q02548 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PAX5Q02548 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PAX5Q02548 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PAX5Q02548 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PAX5Q02548 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PAX5Q02548 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PAX5Q02548 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PAX5Q02548 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
PAX5Q02548 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PAX5Q02548 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PAX5Q02548 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PAX5Q02548 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PAX5Q02548 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PAX5Q02548 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PAX5Q02548 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC19.39■□□□□ 0.7
PAX5Q02548 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PAX5Q02548 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PAX5Q02548 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PAX5Q02548 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PAX5Q02548 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PAX5Q02548 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PAX5Q02548 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PAX5Q02548 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PAX5Q02548 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PAX5Q02548 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PAX5Q02548 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PAX5Q02548 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PAX5Q02548 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms