Protein–RNA interactions for Protein: Q02509

OC90, Otoconin-90, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OC90Q02509 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
OC90Q02509 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
OC90Q02509 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
OC90Q02509 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
OC90Q02509 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
OC90Q02509 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
OC90Q02509 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
OC90Q02509 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
OC90Q02509 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
OC90Q02509 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
OC90Q02509 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
OC90Q02509 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
OC90Q02509 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
OC90Q02509 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
OC90Q02509 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
OC90Q02509 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
OC90Q02509 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
OC90Q02509 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
OC90Q02509 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
OC90Q02509 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
OC90Q02509 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
OC90Q02509 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
OC90Q02509 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
OC90Q02509 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
OC90Q02509 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
OC90Q02509 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
OC90Q02509 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
OC90Q02509 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
OC90Q02509 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
OC90Q02509 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
OC90Q02509 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
OC90Q02509 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
OC90Q02509 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
OC90Q02509 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
OC90Q02509 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
OC90Q02509 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
OC90Q02509 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
OC90Q02509 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
OC90Q02509 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
OC90Q02509 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
OC90Q02509 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
OC90Q02509 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
OC90Q02509 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
OC90Q02509 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
OC90Q02509 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
OC90Q02509 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
OC90Q02509 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
OC90Q02509 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
OC90Q02509 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
OC90Q02509 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
OC90Q02509 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
OC90Q02509 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
OC90Q02509 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
OC90Q02509 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
OC90Q02509 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
OC90Q02509 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
OC90Q02509 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
OC90Q02509 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
OC90Q02509 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
OC90Q02509 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
OC90Q02509 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
OC90Q02509 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
OC90Q02509 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
OC90Q02509 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
OC90Q02509 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
OC90Q02509 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
OC90Q02509 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
OC90Q02509 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
OC90Q02509 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
OC90Q02509 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
OC90Q02509 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
OC90Q02509 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
OC90Q02509 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
OC90Q02509 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
OC90Q02509 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
OC90Q02509 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
OC90Q02509 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
OC90Q02509 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
OC90Q02509 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
OC90Q02509 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
OC90Q02509 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
OC90Q02509 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
OC90Q02509 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
OC90Q02509 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
OC90Q02509 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
OC90Q02509 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
OC90Q02509 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
OC90Q02509 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
OC90Q02509 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
OC90Q02509 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
OC90Q02509 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
OC90Q02509 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
OC90Q02509 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
OC90Q02509 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
OC90Q02509 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
OC90Q02509 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
OC90Q02509 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
OC90Q02509 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
OC90Q02509 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
OC90Q02509 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms