Protein–RNA interactions for Protein: Q01959

SLC6A3, Sodium-dependent dopamine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A3Q01959 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC6A3Q01959 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC6A3Q01959 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC6A3Q01959 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC6A3Q01959 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC6A3Q01959 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC6A3Q01959 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC6A3Q01959 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC6A3Q01959 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC6A3Q01959 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC6A3Q01959 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC6A3Q01959 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC6A3Q01959 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC6A3Q01959 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC6A3Q01959 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC6A3Q01959 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC6A3Q01959 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC6A3Q01959 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC6A3Q01959 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC6A3Q01959 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC6A3Q01959 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC6A3Q01959 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC6A3Q01959 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC6A3Q01959 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC6A3Q01959 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC6A3Q01959 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC6A3Q01959 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC6A3Q01959 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC6A3Q01959 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC6A3Q01959 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC6A3Q01959 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC6A3Q01959 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC6A3Q01959 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC6A3Q01959 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC6A3Q01959 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC6A3Q01959 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC6A3Q01959 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC6A3Q01959 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC6A3Q01959 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC6A3Q01959 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC6A3Q01959 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC6A3Q01959 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC6A3Q01959 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC6A3Q01959 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC6A3Q01959 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC6A3Q01959 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC6A3Q01959 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC6A3Q01959 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC6A3Q01959 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC6A3Q01959 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC6A3Q01959 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC6A3Q01959 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC6A3Q01959 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC6A3Q01959 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC6A3Q01959 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC6A3Q01959 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC6A3Q01959 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC6A3Q01959 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC6A3Q01959 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC6A3Q01959 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC6A3Q01959 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC6A3Q01959 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC6A3Q01959 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC6A3Q01959 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC6A3Q01959 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SLC6A3Q01959 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SLC6A3Q01959 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC6A3Q01959 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC6A3Q01959 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC6A3Q01959 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC6A3Q01959 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC6A3Q01959 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC6A3Q01959 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC6A3Q01959 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC6A3Q01959 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC6A3Q01959 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC6A3Q01959 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC6A3Q01959 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC6A3Q01959 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC6A3Q01959 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC6A3Q01959 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC6A3Q01959 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC6A3Q01959 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC6A3Q01959 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC6A3Q01959 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC6A3Q01959 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC6A3Q01959 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC6A3Q01959 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC6A3Q01959 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC6A3Q01959 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC6A3Q01959 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC6A3Q01959 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC6A3Q01959 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC6A3Q01959 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC6A3Q01959 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC6A3Q01959 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC6A3Q01959 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC6A3Q01959 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC6A3Q01959 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC6A3Q01959 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms