Protein–RNA interactions for Protein: Q01850

CDR2, Cerebellar degeneration-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDR2Q01850 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CDR2Q01850 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CDR2Q01850 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CDR2Q01850 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CDR2Q01850 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CDR2Q01850 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CDR2Q01850 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CDR2Q01850 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CDR2Q01850 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CDR2Q01850 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CDR2Q01850 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CDR2Q01850 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CDR2Q01850 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CDR2Q01850 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CDR2Q01850 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CDR2Q01850 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CDR2Q01850 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CDR2Q01850 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CDR2Q01850 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CDR2Q01850 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CDR2Q01850 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CDR2Q01850 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CDR2Q01850 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CDR2Q01850 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CDR2Q01850 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CDR2Q01850 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CDR2Q01850 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CDR2Q01850 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CDR2Q01850 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CDR2Q01850 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CDR2Q01850 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CDR2Q01850 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CDR2Q01850 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CDR2Q01850 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CDR2Q01850 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CDR2Q01850 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CDR2Q01850 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CDR2Q01850 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CDR2Q01850 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CDR2Q01850 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CDR2Q01850 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CDR2Q01850 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
CDR2Q01850 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CDR2Q01850 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CDR2Q01850 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CDR2Q01850 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CDR2Q01850 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CDR2Q01850 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CDR2Q01850 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CDR2Q01850 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CDR2Q01850 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CDR2Q01850 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CDR2Q01850 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CDR2Q01850 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CDR2Q01850 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
CDR2Q01850 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CDR2Q01850 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CDR2Q01850 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CDR2Q01850 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDR2Q01850 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDR2Q01850 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDR2Q01850 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDR2Q01850 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDR2Q01850 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDR2Q01850 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDR2Q01850 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDR2Q01850 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDR2Q01850 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CDR2Q01850 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CDR2Q01850 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CDR2Q01850 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CDR2Q01850 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CDR2Q01850 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CDR2Q01850 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
CDR2Q01850 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CDR2Q01850 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CDR2Q01850 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CDR2Q01850 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CDR2Q01850 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CDR2Q01850 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CDR2Q01850 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CDR2Q01850 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CDR2Q01850 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CDR2Q01850 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CDR2Q01850 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CDR2Q01850 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CDR2Q01850 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CDR2Q01850 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CDR2Q01850 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CDR2Q01850 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDR2Q01850 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CDR2Q01850 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDR2Q01850 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDR2Q01850 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDR2Q01850 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDR2Q01850 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CDR2Q01850 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CDR2Q01850 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CDR2Q01850 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CDR2Q01850 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms