Protein–RNA interactions for Protein: Q01826

SATB1, DNA-binding protein SATB1, humanhuman

Predictions only

Length 763 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SATB1Q01826 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SATB1Q01826 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SATB1Q01826 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
SATB1Q01826 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SATB1Q01826 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SATB1Q01826 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SATB1Q01826 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SATB1Q01826 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
SATB1Q01826 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SATB1Q01826 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SATB1Q01826 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SATB1Q01826 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SATB1Q01826 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SATB1Q01826 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SATB1Q01826 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SATB1Q01826 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SATB1Q01826 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SATB1Q01826 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
SATB1Q01826 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SATB1Q01826 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SATB1Q01826 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SATB1Q01826 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SATB1Q01826 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SATB1Q01826 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SATB1Q01826 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SATB1Q01826 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SATB1Q01826 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SATB1Q01826 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SATB1Q01826 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SATB1Q01826 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SATB1Q01826 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SATB1Q01826 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SATB1Q01826 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SATB1Q01826 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SATB1Q01826 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SATB1Q01826 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SATB1Q01826 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SATB1Q01826 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SATB1Q01826 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SATB1Q01826 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SATB1Q01826 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SATB1Q01826 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SATB1Q01826 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
SATB1Q01826 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SATB1Q01826 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SATB1Q01826 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SATB1Q01826 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SATB1Q01826 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SATB1Q01826 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SATB1Q01826 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SATB1Q01826 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SATB1Q01826 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
SATB1Q01826 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SATB1Q01826 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SATB1Q01826 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SATB1Q01826 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SATB1Q01826 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SATB1Q01826 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SATB1Q01826 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SATB1Q01826 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SATB1Q01826 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SATB1Q01826 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SATB1Q01826 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SATB1Q01826 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
SATB1Q01826 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SATB1Q01826 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SATB1Q01826 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
SATB1Q01826 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SATB1Q01826 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SATB1Q01826 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SATB1Q01826 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SATB1Q01826 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SATB1Q01826 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SATB1Q01826 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SATB1Q01826 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SATB1Q01826 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SATB1Q01826 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SATB1Q01826 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SATB1Q01826 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SATB1Q01826 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SATB1Q01826 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SATB1Q01826 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SATB1Q01826 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SATB1Q01826 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SATB1Q01826 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SATB1Q01826 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SATB1Q01826 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SATB1Q01826 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SATB1Q01826 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SATB1Q01826 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SATB1Q01826 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SATB1Q01826 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SATB1Q01826 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SATB1Q01826 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SATB1Q01826 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SATB1Q01826 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SATB1Q01826 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SATB1Q01826 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SATB1Q01826 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SATB1Q01826 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms