Protein–RNA interactions for Protein: Q01453

PMP22, Peripheral myelin protein 22, humanhuman

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMP22Q01453 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
PMP22Q01453 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PMP22Q01453 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PMP22Q01453 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
PMP22Q01453 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PMP22Q01453 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PMP22Q01453 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PMP22Q01453 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PMP22Q01453 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PMP22Q01453 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PMP22Q01453 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PMP22Q01453 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PMP22Q01453 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PMP22Q01453 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PMP22Q01453 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PMP22Q01453 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■□□□□ 0.99
PMP22Q01453 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PMP22Q01453 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PMP22Q01453 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
PMP22Q01453 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PMP22Q01453 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
PMP22Q01453 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PMP22Q01453 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
PMP22Q01453 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PMP22Q01453 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PMP22Q01453 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PMP22Q01453 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PMP22Q01453 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PMP22Q01453 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PMP22Q01453 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PMP22Q01453 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PMP22Q01453 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PMP22Q01453 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
PMP22Q01453 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PMP22Q01453 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PMP22Q01453 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PMP22Q01453 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PMP22Q01453 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PMP22Q01453 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PMP22Q01453 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PMP22Q01453 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PMP22Q01453 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PMP22Q01453 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PMP22Q01453 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PMP22Q01453 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PMP22Q01453 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PMP22Q01453 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PMP22Q01453 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
PMP22Q01453 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PMP22Q01453 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PMP22Q01453 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
PMP22Q01453 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PMP22Q01453 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PMP22Q01453 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
PMP22Q01453 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PMP22Q01453 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PMP22Q01453 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
PMP22Q01453 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PMP22Q01453 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PMP22Q01453 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PMP22Q01453 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PMP22Q01453 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PMP22Q01453 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PMP22Q01453 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
PMP22Q01453 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PMP22Q01453 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
PMP22Q01453 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PMP22Q01453 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PMP22Q01453 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PMP22Q01453 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PMP22Q01453 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PMP22Q01453 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PMP22Q01453 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
PMP22Q01453 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PMP22Q01453 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PMP22Q01453 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PMP22Q01453 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PMP22Q01453 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PMP22Q01453 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PMP22Q01453 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PMP22Q01453 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
PMP22Q01453 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PMP22Q01453 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PMP22Q01453 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PMP22Q01453 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PMP22Q01453 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PMP22Q01453 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PMP22Q01453 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PMP22Q01453 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PMP22Q01453 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PMP22Q01453 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PMP22Q01453 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PMP22Q01453 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PMP22Q01453 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PMP22Q01453 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PMP22Q01453 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PMP22Q01453 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PMP22Q01453 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PMP22Q01453 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PMP22Q01453 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms