Protein–RNA interactions for Protein: Q00403

GTF2B, Transcription initiation factor IIB, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2BQ00403 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GTF2BQ00403 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GTF2BQ00403 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GTF2BQ00403 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GTF2BQ00403 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GTF2BQ00403 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GTF2BQ00403 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GTF2BQ00403 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GTF2BQ00403 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GTF2BQ00403 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
GTF2BQ00403 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GTF2BQ00403 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
GTF2BQ00403 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
GTF2BQ00403 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
GTF2BQ00403 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
GTF2BQ00403 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
GTF2BQ00403 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
GTF2BQ00403 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
GTF2BQ00403 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
GTF2BQ00403 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GTF2BQ00403 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GTF2BQ00403 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GTF2BQ00403 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GTF2BQ00403 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GTF2BQ00403 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GTF2BQ00403 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GTF2BQ00403 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GTF2BQ00403 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
GTF2BQ00403 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
GTF2BQ00403 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
GTF2BQ00403 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GTF2BQ00403 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GTF2BQ00403 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GTF2BQ00403 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GTF2BQ00403 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GTF2BQ00403 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GTF2BQ00403 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GTF2BQ00403 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GTF2BQ00403 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GTF2BQ00403 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GTF2BQ00403 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GTF2BQ00403 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GTF2BQ00403 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GTF2BQ00403 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
GTF2BQ00403 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GTF2BQ00403 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
GTF2BQ00403 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
GTF2BQ00403 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
GTF2BQ00403 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
GTF2BQ00403 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
GTF2BQ00403 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
GTF2BQ00403 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
GTF2BQ00403 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
GTF2BQ00403 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
GTF2BQ00403 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
GTF2BQ00403 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
GTF2BQ00403 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
GTF2BQ00403 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
GTF2BQ00403 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
GTF2BQ00403 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
GTF2BQ00403 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
GTF2BQ00403 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
GTF2BQ00403 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GTF2BQ00403 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GTF2BQ00403 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GTF2BQ00403 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
GTF2BQ00403 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
GTF2BQ00403 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GTF2BQ00403 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GTF2BQ00403 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
GTF2BQ00403 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GTF2BQ00403 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
GTF2BQ00403 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
GTF2BQ00403 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GTF2BQ00403 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
GTF2BQ00403 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
GTF2BQ00403 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
GTF2BQ00403 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
GTF2BQ00403 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GTF2BQ00403 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GTF2BQ00403 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
GTF2BQ00403 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
GTF2BQ00403 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GTF2BQ00403 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
GTF2BQ00403 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
GTF2BQ00403 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GTF2BQ00403 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GTF2BQ00403 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GTF2BQ00403 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
GTF2BQ00403 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
GTF2BQ00403 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GTF2BQ00403 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
GTF2BQ00403 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GTF2BQ00403 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GTF2BQ00403 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GTF2BQ00403 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GTF2BQ00403 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GTF2BQ00403 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GTF2BQ00403 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GTF2BQ00403 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms