Protein–RNA interactions for Protein: P82279

CRB1, Protein crumbs homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRB1P82279 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
CRB1P82279 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
CRB1P82279 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC31.48■■■□□ 2.63
CRB1P82279 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
CRB1P82279 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC31.47■■■□□ 2.63
CRB1P82279 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC31.47■■■□□ 2.63
CRB1P82279 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
CRB1P82279 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC31.46■■■□□ 2.63
CRB1P82279 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC31.46■■■□□ 2.63
CRB1P82279 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.46■■■□□ 2.63
CRB1P82279 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC31.46■■■□□ 2.63
CRB1P82279 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC31.46■■■□□ 2.63
CRB1P82279 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.45■■■□□ 2.63
CRB1P82279 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
CRB1P82279 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
CRB1P82279 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
CRB1P82279 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
CRB1P82279 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC31.45■■■□□ 2.63
CRB1P82279 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC31.45■■■□□ 2.63
CRB1P82279 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.45■■■□□ 2.63
CRB1P82279 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC31.45■■■□□ 2.63
CRB1P82279 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC31.45■■■□□ 2.63
CRB1P82279 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
CRB1P82279 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
CRB1P82279 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.44■■■□□ 2.62
CRB1P82279 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC31.44■■■□□ 2.62
CRB1P82279 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC31.43■■■□□ 2.62
CRB1P82279 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC31.43■■■□□ 2.62
CRB1P82279 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
CRB1P82279 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
CRB1P82279 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC31.43■■■□□ 2.62
CRB1P82279 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
CRB1P82279 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
CRB1P82279 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
CRB1P82279 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.43■■■□□ 2.62
CRB1P82279 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
CRB1P82279 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC31.43■■■□□ 2.62
CRB1P82279 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.43■■■□□ 2.62
CRB1P82279 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
CRB1P82279 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC31.42■■■□□ 2.62
CRB1P82279 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
CRB1P82279 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
CRB1P82279 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC31.41■■■□□ 2.62
CRB1P82279 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
CRB1P82279 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC31.41■■■□□ 2.62
CRB1P82279 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
CRB1P82279 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC31.41■■■□□ 2.62
CRB1P82279 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
CRB1P82279 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
CRB1P82279 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
CRB1P82279 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
CRB1P82279 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
CRB1P82279 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC31.4■■■□□ 2.62
CRB1P82279 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
CRB1P82279 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC31.39■■■□□ 2.62
CRB1P82279 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.39■■■□□ 2.62
CRB1P82279 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
CRB1P82279 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
CRB1P82279 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
CRB1P82279 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC31.39■■■□□ 2.62
CRB1P82279 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC31.39■■■□□ 2.61
CRB1P82279 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.38■■■□□ 2.61
CRB1P82279 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.38■■■□□ 2.61
CRB1P82279 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC31.38■■■□□ 2.61
CRB1P82279 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
CRB1P82279 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.37■■■□□ 2.61
CRB1P82279 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC31.37■■■□□ 2.61
CRB1P82279 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
CRB1P82279 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
CRB1P82279 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
CRB1P82279 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC31.36■■■□□ 2.61
CRB1P82279 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC31.36■■■□□ 2.61
CRB1P82279 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
CRB1P82279 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.35■■■□□ 2.61
CRB1P82279 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
CRB1P82279 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
CRB1P82279 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
CRB1P82279 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
CRB1P82279 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.35■■■□□ 2.61
CRB1P82279 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
CRB1P82279 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
CRB1P82279 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
CRB1P82279 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC31.34■■■□□ 2.61
CRB1P82279 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
CRB1P82279 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
CRB1P82279 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
CRB1P82279 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.33■■■□□ 2.61
CRB1P82279 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
CRB1P82279 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.32■■■□□ 2.61
CRB1P82279 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.61
CRB1P82279 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC31.32■■■□□ 2.61
CRB1P82279 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC31.32■■■□□ 2.6
CRB1P82279 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC31.32■■■□□ 2.6
CRB1P82279 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC31.32■■■□□ 2.6
CRB1P82279 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
CRB1P82279 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
CRB1P82279 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
CRB1P82279 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC31.31■■■□□ 2.6
CRB1P82279 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
CRB1P82279 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms